马婕, 李开枝, 邱大俊, 谭烨辉, 黄良民,3,* , 张俊彬
基于高通量测序技术大亚湾肥胖软箭虫()的食性分析
马婕1,2,4, 李开枝2, 邱大俊2, 谭烨辉2, 黄良民2,3,*, 张俊彬1,4,*
1. 国家实验渔业科学教育示范中心, 农业部水产遗传资源开发利用重点实验室, 上海海洋大学上海水产养殖工程研究中心, 上海 201306 2. 中国科学院南海海洋研究所, 中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室, 广州 510301 3. 中国科学院大学, 北京 100049 4.深圳大学生命科学与海洋学院, 深圳市海洋生物资源与生态环境科学重点实验室, 深圳 518000
采用Illuminate高通量测序技术分析了大亚湾肥胖软箭虫()的食性。在夏季(2017年8月)和冬季(2018年1月)对大亚湾内不同站位拖网采获的四组样品中, 分别挑取毛颚类优势种肥胖软箭虫进行18S rDNA V4区扩增; 通过高通量测序得到四组样品的序列, 经过处理每组样品得到约30,000条高质量序列。分析结果表明, 大亚湾肥胖软箭虫的食物来源于16个门类生物, 主要的优势类群分别来自于3个门类的浮游动物(刺胞动物门46.16%、节肢动物门的桡足类19.16%和栉水母动物门14.22%), 真菌类的2个门类(子囊菌门14.04%和担子菌亚门4.48%), 以及少量浮游植物类群的2个门 (褐藻门0.06%和隐藻门0.03%)。另外, 还检测出少量肥胖软箭虫可能摄食的纤毛虫、线虫、住囊虫、海葵等。夏季湾内肥胖软箭虫食物中子囊菌门贡献最高 (43.3%), 这与大亚湾海水养殖等人类活动影响有关; 夏季湾口外海水带来丰富的暖水性栉水母, 占肥胖软箭虫总食物丰度的55.25%。冬季湾内肥胖软箭虫摄食哲水蚤比例达49.94%, 而湾口肉质介穗水母占比高达85.3%。……