2006-2016年贵州省炭疽芽胞杆菌SNR分型分析

马 青,杨 平,刘 英,王 月,聂 炜,姚光海,李世军

炭疽是一种自然疫源性疾病，具有全球流行性。炭疽芽胞杆菌是炭疽的病原体，属于需氧芽胞杆菌属细菌，可感染各种家畜、野生动物及人类。由于其病原体的环境耐受性和感染破坏性等特点，炭疽无法根除。人类主要通过接触炭疽病畜毛皮和食肉而感染，也可以通过吸入含有炭疽芽胞的粉尘或气溶胶而感染，主要表现为皮肤炭疽，其次为肺炭疽、肠炭疽和脑膜炎炭疽[1]。

炭疽芽胞杆菌在遗传过程中，基因组上存在能稳定遗传的单核苷酸突变位点，单核苷酸重复序列分析(Single-Nucleotide Repeat Analysis, SNR)通过分析不同分离株之间等位基因上单碱基的重复数，可区分同一MLVA型的近缘分离株，从而更细致的反映细菌的遗传进化差异，SNR因此成为分子流行病学调查的有效技术手段，近年来被广泛用于炭疽杆菌分型研究[2]。本研究采用SNR方法对来自贵州省2006-2016年间不同地区的炭疽芽胞杆菌进行SNR分析，探讨其SNR型别分布特征，为炭疽疫情监测、调查与溯源提供技术手段和科学依据。

1 材料与方法

1.1菌株来源 本研究所用菌株为本实验室2006-2016年间收集保存的贵州省各地区炭疽芽胞杆菌，共71株。其中5株来自患者标本(4株分离自皮肤渗出物，1株分离自全血)，3株来自动物标本(狗肝、狗脾、病死牛肺各分离1株)，63株来自外环境标本(2株分离自牲畜饮用水， 61株分离自土壤)。

1.2主要试剂 血琼脂平板购自郑州博赛公司，Taqmix聚合酶、灭菌去离子水、DNAMarker、琼脂糖均购自大连宝生物工程有限公司。……