中国肠道菌群研究近20年文献大数据分析

高春辉，张秀梅，李丹宜，蓝灿辉，赵杰，翟运开，赵萌

肠道菌群是人体肠道的正常微生物，如双歧杆菌、乳酸杆菌等能合成多种人体生长发育必需的维生素。这些营养物质对人类的健康有着重要作用，一旦缺乏会引起多种疾病。人体肠道内寄生着 10 万亿个细菌，它们能影响体重和消化能力、抵御感染和自体免疫疾病的患病风险，还能控制人体对癌症治疗药物的反应。文章检索了 Web of Science 数据库和万方数据库的相关文献，通过文献计量学的方法分析阐述了中国近 20年肠道菌群的研究历程和进展。

1 资料和方法

1.1 检索策略

文章的英文文献数据来源于科睿唯安的 Web of Science 数据库核心集，访问时间为 2020年4月1日。限定条件：检索年限从 2000-2020年；检索词是“肠道”和“菌群”（及其同义词），检索式：“TS=(gut OR intestine OR bowel OR intestinal OR colon OR colorectal OR gastrointestine OR gastrointestinal) AND TS=(microbiome OR microbiota OR flora OR microbe OR microbes OR commensal OR symbiont OR pathobiont OR mycobiome OR virome OR metagenome OR meta-genome)”。

文章的中文文献数据来源于万方数据库，访问时间为2020年9月8日。限定条件：医药、卫生；中文；正式出版。检索式：(主题:(肠道)*主题:(菌群))*Date:2000-2019。检索结果：8828 篇。部分指标分析结果来源于万方医学网。

1.2 文献计量学分析

文献计量数据分析主要基于 R 语言软件包 Bibliometrix[1]和一系列 R 语言工具，包括 visNetwork（https://CRAN.Rproject.org/package=visNetwork），ggplot2（https://ggplot2.tidyverse.org），UpSetR（https://CRAN.R-project.org/package=UpSetR）等。

2 结果

2.1 中国肠道菌群研究的Web of Science 数据库分析结果

2.1.1 发文量分析 根据 Web of Science 数据库平台的数据，在过去的 20年间（2000-2019年），全世界一共发表了 55914 篇与“肠道菌群”相关的研究论文。

在世界范围内，美国是肠道菌群研究的领跑者，而中国发表论文的数量和比例也在双双增加。在 20年前，中国基本没有相关的研究论文；在 10年前，即 2010年，中国发表相关研究 82 篇，占当年全世界总发文量的 5%；……