周 健,张子安,赵海波,于腾波*,张英泽
(1.青岛大学附属青岛市市立医院骨科;2.青岛大学附属医院骨科,山东青岛 266003)
骨关节炎(osteoarthritis,OA)是一种以关节软骨退变、软骨下骨重构以及滑膜炎症为主要特征的慢性退行性骨关节疾病,可以导致软骨细胞表型和软骨稳态发生改变,好发于髋、膝关节,临床表现为关节疼痛、关节僵硬,严重者可致关节畸形,导致关节活动受限,严重降低了患者的生活质量[1~2]。探索OA的分子发病机制,延缓OA进程,寻找新的诊断及预防手段,一直是骨科领域研究的焦点问题。传统的RNA测序技术(bulk RNA-seq)是将组织中的细胞RNA混合后进行分析,无法获取单个细胞的信息。单细胞转录组测序(single cell RNA sequencing,scRNA-seq)可以对组织中的细胞进行独立分析,在细胞图谱构建、细胞亚群细化及稀有细胞类型鉴定、疾病标志性致病基因及干细胞发育分化等过程中发挥重要作用。目前单细胞测序技术已经在肿瘤、心血管病、神经科学等诸多学科广泛应用[3~6],但在骨关节领域,包括OA、类风湿关节炎(rheu⁃matoid arthritis,RA)、创伤性关节炎以及滑膜炎等疾病的研究还处于起步阶段。随着研究的不断深入,OA的分子发病机制与发病过程、细胞类型与疾病之间的关系、病变的软骨细胞如何再生等问题会有新的见解。本文对scRNA-seq技术及在OA方面的应用进行概述。
scRNA-seq技术是从单个细胞水平获得全转录组的表达谱,可以揭示单细胞的基因表达情况、细胞间基因的交互调控网络,寻找细胞间异质性。真核细胞包含许多不同的RNA,目前以检测mRNA为主,长链非编码 RNA(lncRNA)和环状 RNA(circRNA)等也可被检测[7,8]。……