基于转录组测序的越南安息香根、茎和叶基因表达分析

王小敏，许婳婳，詹若挺，马新业*

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基于转录组测序的越南安息香根、茎和叶基因表达分析

王小敏1，许婳婳2，詹若挺1，马新业1*

1. 广州中医药大学 中药资源科学与工程研究中心，岭南中药资源教育部重点实验室，国家中成药工程技术研究中心 南药研发实验室，广东 广州 510006 2. 广州中医药大学中药学院，广东 广州 510006

对越南安息香进行转录组测序，获得其根、茎和叶的转录组信息特征。以越南安息香的根、茎和叶作为研究对象，使用Illumina HiSeqTM2000进行越南安息香根、茎和叶的转录组测序分析。转录组测序根、茎和叶共获得53 835 045条高质量序列（clean reads）,Trinity de novo组装获得69 151条Unigenes，平均长度778.51 nt。BLAST分析表明分别有41 412（59.89%）、31 189（45.10%）、25 539（36.93%）、16 749（24.22%）个Unigenes在Nr、Swiss-port、KOG、KEGG数据库中得到注释，可归入GO分类的细胞组分、生物过程和分子功能3大类46分支，涉及129条KEGG标准代谢通路，其中有31个次生代谢标准通路。蛋白编码框序列3 461个，涉及高等植物转录因子54个家族。使用MISA软件挖掘10 974个简单重复序列（SSRs），二碱基重复SSRs数量最为丰富，有6282个（57.24%），五碱基重复SSRs最少，占2.45%。利用高通量技术和生物信息分析获得了越南安息香根、茎和叶的转录组信息特征，为后期越南安息香基因功能鉴定、次生代谢途径解析及调控机制的研究奠定基础。

越南安息香；转录组；功能基因；代谢通路；简单重复序列

越南安息香(Pierre) Crail ex Har-tw.为安息香科（Styracaceae）安息香属落叶乔木，又名越南安息香、白背安息香和滇桂野茉莉，俗称“东京野茉莉”，广泛分布于我国岭南地区，老挝、缅甸等国也有分布；其茎皮受到伤害后的分泌物干燥后作为安息香[1]，始载于《新修本草》，味辛、苦，平，无毒；……