肿瘤突变负荷位点检测准确性评价

孙楠 于婷 张文新 贾峥 黄杰 曲守方

肿瘤免疫治疗是通过激发或调动机体自身的免疫系统，解除肿瘤细胞对于自身免疫系统的抑制，达到调控和杀伤肿瘤细胞的目的。免疫治疗这种全新的治疗模式也为肿瘤患者带来了新的机遇。其中免疫检查点抑制剂（Immune Checkpoint Inhibitor，ICI）给恶性肿瘤治疗带来了新的选择，包括程序性死亡受体1（PD-1）抑制剂及其配体（PDL1）抑制剂，以及细胞毒性T 淋巴细胞相关抗原4（CTLA-4）抑制剂等［1-2］。肿瘤突变负荷（tumour mutation burden，TMB）是预测患者对免疫检查点抑制剂治疗反应的新兴生物标志物，识别可能受益于免疫治疗的肿瘤患者［3-4］。已有研究表明，与低TMB 相比，高TMB 患者的免疫治疗效果更好［5-6］。

常见的TMB 检测方法是对肿瘤组织切片或血液标本进行高通量测序（Next-generation sequencing，NGS），包括全外显子（Whole Exome Sequencing，WES）测序和试剂盒（Panel）靶向测序等方法［7-8］。虽然肿瘤组织全外显子测序是公认的检测TMB 的金标准，但其测序成本较高、周期长，并且对肿瘤组织标本大小和肿瘤细胞含量有较高要求，在临床实践中难以广泛使用。国内外有多家体外诊断试剂公司都在二代测序平台上开发了TMB 检测试剂盒（Panel），用经过验证的panel 算法来计算TMB，期望替代全外显子测序。中国食品药品检定研究院（简称中简院）建立肿瘤突变负荷检测（TMB）国家参考品，包括高置信单核苷酸多态性和插入缺失（Single nucleotide polymorphisims/insertion-deletion，SNP/Indel）位点标准集，用来考察试剂盒（Panel）的位点检测准确性。

1 材料与方法

1.1 样本

肿瘤突变负荷检测国家参考品由简称中检院提供。

1.2 试剂与仪器

核酸纯化试剂和TMB 检测试剂盒（可逆末端终止测序法），购自南京世和医疗器械有限公司；……