mNGS技术在儿童重症肺炎病原学诊断中的价值

黄珮琪 陆小霞 陈和斌 杜慧 李颖 陈红卫

社区获得性肺炎（community acquired pneumonia，CAP）是儿童期常见感染性疾病，也是5 岁以下儿童死亡的首位病因［1］。由于小儿肺功能发育不完全、抵抗力较弱，7%～13%肺炎可发展为重症肺炎，给家庭带来沉重负担［2-3］。目前常用检查方法有传统微生物培养、核酸扩增检测、分子免疫学检查等，但这些检测方法存在样本处理过程复杂、花费时间长、病原体检测种类少等缺点［4］。宏基因组二代测序（Metagenomic next generation sequencing，mNGS）是一种不依赖于分离培养的新兴病原体检测技术［5］。以其不需培养、鉴定速度快、准确率高等优点逐步应用于感染性疾病领域［6］。本研究对219 例社区获得性重症肺炎患儿的病原学mNGS 资料进行分析，旨在为临床诊断提供理论依据，现报道如下。

1 资料与方法

1.1 一般资料

选取2017年12月至2020年6月武汉儿童医院收治住院治疗的219 例社区获得性重症肺炎患儿临床资料。纳入标准：①所有患儿均参照中华医学会儿科学分会呼学组制定的《儿童社区获得性肺炎管理指南（2013 版）》［7］。②患儿均有行支气管镜术的适应症［8］，并与家长签署支气管镜检查的知情同意书，且家长同意行mNGS 检查。③临床资料完整。排除标准：①因其他原因入院，院内发展为重症肺炎；②合并其他免疫缺陷疾病。本研究经医院伦理委员会批准。

1.2 方法

所有患儿入院当天采样，完善血常规、CRP、PCT、（1，3）-β-D 葡聚糖检测（G 试验）、半乳甘露聚糖检测（GM 试验）、肺炎支原体抗体等检查。219 例患儿均进行支气管镜检查，采集其肺泡灌洗液并分为两份，一份送检一般细菌涂片及培养，另一份送检mNGS，标本转运符合规范要求。……