基于重测序数据的湖羊产羔数性状全基因组关联分析

谢锐，朱墨，童世锋，赵福平，刘杨*

(1. 南京农业大学动物科技学院，江苏 南京 210095； 2. 农业农村部都市农业重点实验室，上海 200240；3. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，北京 100193)

繁殖性状是羊的重要经济性状，繁殖性能的高低直接决定了整个养殖经济效益的高低。如何提高羊产羔数一直是科学家们致力于研究解决的重要课题。提高母羊产羔数的前提是提高母羊的排卵数，而哺乳动物的排卵过程受到复杂的机制调控，而且不同品种羊之间还存在着显著差异，如特塞尔绵羊和萨福克羊每个排卵周期只排1个卵，而高产的布鲁拉美利奴羊每个排卵周期可以排10个卵[1]。除了国外的羊具有优秀繁殖性能外，我国本地绵羊品种湖羊也因具有“一年多胎，一胎多羔”的优秀繁殖性能而闻名世界。但影响湖羊产羔数的关键功能基因以及高繁殖力性状的遗传机理还有待进一步研究。

随着二代基因组测序技术的快速发展，越来越多的研究利用基因组测序方法来寻找与羊繁殖性状有关的候选基因，这为从基因组水平上研究目标经济性状提供了便利。全基因组关联分析(GWAS)是在全基因组范围内寻找与动植物重要经济性状相关联的遗传变异，是一种复杂性状功能基因鉴定的分析策略[2]。GWAS概念是由Risch在1996年提出[3]，最早是被应用在医学上研究复杂疾病的遗传模式[4]。GWAS方法因具有速度快、通量高和高精度等显著优点,其在畜牧学遗传育种中的作用日益凸显，目前已经成为挖掘与家畜重要经济性状相关候选基因最重要的方法之一[5]。……