人丝氨酸蛋白酶抑制剂B3基因的生物信息学分析

李靖飞, 许威, 张顺, 李峰

人丝氨酸蛋白酶抑制剂B3基因的生物信息学分析

李靖飞, 许威, 张顺, 李峰

(湖南文理学院 生命与环境科学学院, 湖南 常德, 415000)

人丝氨酸蛋白酶抑制剂B3 SERPINB3能抑制半胱氨酸蛋白酶, 具有抗细胞调亡、促进细胞增殖和迁移作用, 且与许多肿瘤的发生与发展密切相关。通过基因电子克隆(in silico cloning)获得SERPINB3基因全长cDNA序列(1 779 bp), 编码由390个氨基酸组成的蛋白质。核酸序列分析表明: SERPINB3基因位于人体18号染色体长臂(18q21.33), 基因组跨越80 373 285 bp, 含有个16外显子, 15个内含子, 其cDNA序列上总共有45个酶切位点。SERPINB基因核酸序列同源性分析显示, 人类与黑猩猩的亲缘关系较近, 与白眉猴和猕猴的亲缘关系是最远。SERPINB3蛋白序列同源性分析显示, 人类和黑猩猩亲缘关系较近, 和苍疣猴亲缘关系较远。SERPINB3相互作用蛋白的生物信息学分析表明: 与SERPINB3相互作用的蛋白中, 以丝氨酸蛋白酶家族成员居多, 且大多在调节炎症反应、细胞增殖分化以及凋亡等方面起着关键作用。本论文通过对SERPINB3基因的生物信息学分析, 为SERPINB3的功能和分子进化研究提供更多的生物信息学参考。

SERPINB3; 基因; 生物信息学分析

人丝氨酸蛋白酶抑制剂B3(SERPINB3)能抑制半胱氨酸蛋白酶如组织蛋白酶K、L、S和V, 具有抗细胞调亡、促进细胞增殖和迁移作用, 与许多肿瘤的发生发展及侵袭迁移密切相关[1]。SERPINB4能抑制糜蛋白酶样丝氨酸蛋白酶, 如组织蛋白酶G和肥大细胞糜酶, 通过p38MAPK信号通路抑制肿瘤细胞凋亡[2]。此外还有研究发现SERPINB3和SERPINB4均高表达于宫颈癌、肺癌、食管癌和头颈部肿瘤等鳞状细胞癌[3]。……