hsa-miR-125a的靶基因预测及生物信息学分析*

杨一秋 李 兰 赵 娜 解继胜

1 右江民族医学院免疫学专业在读硕士研究生，广西百色市 533000； 2 右江民族医学院基础医学院组织胚胎学教研室

骨质疏松症(Osteoporosis，OP)是一种常见的骨骼疾病，以降低骨量，破坏骨微结构为特征，最终引起骨骼脆弱并增加骨折风险[1]。骨质疏松症是一种与年龄密切相关的骨骼疾病。最严重的后果是骨折，骨质疏松性骨折危害巨大，给老年患者的生活带来巨大痛苦并且对于家庭和社会来说也是一个沉重的负担。MicroRNA(miRNA)是一种内源性非编码小分子RNA，可以降解或抑制靶基因的蛋白表达，在转录后水平调控中发挥重要作用[2]。前期通过miRNA芯片技术分析人外周血单核细胞向破骨细胞分化过程中差异表达的miRNA，并通过实时荧光定量PCR验证芯片结果中上调或下调的miRNA。发现hsa-miR-125a下调最为明显，结果提示hsa-miR-125a可能是诊断骨质疏松症的生物标志物，但其具体调控机制还不清楚。因此，本研究拟通过生物信息学分析方法预测hsa-miR-125a的靶基因及信号通路，为进一步分析hsa-miR-125a在骨质疏松发生、发展中的调控机制提供理论基础。

1 材料和方法

1.1 hsa-miR-125a的物种保守性分析 利用miRBase(http://www.mirbase.org)数据库检索hsa-miR-125a的序列并分析其物种保守性。

1.2 hsa-miR-125a的靶基因预测 通过TargetScan(http://www.targetscan.org)、miRTarBase(http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/index.php)、miRDB(http://mirdb.org)这三个靶基因数据库在线预测hsa-miR-125a的靶基因，对三者所预测的结果绘制venny图，得到交集靶基因。

1.3 hsa-miR-125a预测靶基因的GO及KEGG信号通路富集分析 将hsa-miR-125a预测的靶基因集合，通过DAVID数据库，进行基因本体(Gene ontology，GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes，KEGG)信号通路富集分析。……