TREM1 在胶质母细胞瘤中的表达及其预后意义

2021-05-13 14:03:02王远传梁若飞
医学信息 2021年9期
关键词:数据库分析研究

王 京,王远传,梁若飞

(1.川北医学院临床医学系,四川 南充 637000;2.川北医学院附属医院神经外科,四川 南充 637000)

胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)是世界卫生组织(WHO)分类的Ⅳ级胶质瘤,是死亡率最高,且最难治愈的恶性脑肿瘤。原发性中枢神经系统恶性肿瘤中GBM 的最高发病率为3.20/10 万[1]。根据美国中央脑肿瘤登记中心(CBTRUS)2011 年~2015 年统计报告,胶质母细胞瘤约占所有神经上皮肿瘤的年平均发病率的57%,约占所有恶性脑和中枢神经系统肿瘤的48%[2]。目前标准治疗(手术结合放疗和化疗)在提高GBM 患者的总生存期方面并不满意,同时新的治疗方式并未使患者生存率得到实质性的改善[3]。因此,发现GBM 诊断和治疗的新靶点,寻找评估预后的新指标已成为目前GBM 研究的热点。髓样细胞触发受体1(triggering receptor expressed on myeloid cells-1,TREM1)是近年来发现的一种炎症反应因子[4]。而炎症反应在肿瘤的不同阶段,包括发生、发展、恶性转化、侵袭和转移等过程中都发挥着重要的作用[5]。已有研究证实TREM1 基因在直肠癌、卵巢癌、肝细胞癌等[6-9]多种恶性肿瘤中显著高表达,并与患者的预后关系密切。本研究主要分析TREM1 基因在GBM 中的表达状况,并探讨其预后意义,仪器为研究TREM1 基因在GBM 发生、发展中的作用提供参考。

1 材料与方法

1.1 数据来源 Oncomine 数据库[10](https://www.oncomine.org/);GEPIA 数据库[11](http://gepia.cancerpku.cn/);String 数据库[12](https://string-db.org)。

1.2 方法 运用Oncomine 数据库分析GBM 组织与正常对照组织TREM1 基因在mRNA 上的差异性表达情况,检索条件:①Analysis type:Cancer vs Normal Analysis;②Gene:TREM1;③Data type:mRNA;④Cancer type:Glioblastoma;⑤临界值设定条件:P value<1E-4;fold change>2.0,gene rank=top 10%。应用GEPIA 数据库检索得到人体常见肿瘤及其相应正常对照组织中TREM1 基因的表达情况,检索方式:Quick search:TREM1;进一步检索TREM1 在GBM 组织与正常对照组织中的表达情况,检索方式:①Expression on box plots;……

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