“局外人”推动的生物信息学革命

2021-05-17 12:59:45王瑢
风流一代·经典文摘 2021年5期
关键词:计算机数据库研究

王瑢

1984年,美国国家生物医学研究基金会启动了一个免费在线数据库项目——蛋白质信息资源数据库(PIR),其中包含超过28.3万种蛋白质序列。如今,世界各地的科学家都可以将其获得的未知蛋白质与该数据库中的已知蛋白质进行比对,考察它们的相似性和差异性。借助这些数据,科学家能够快速、准确地推断出某种蛋白质的进化史,及其与各种生命形式的关系。

这个规模庞大的在线数据库的建立,要归功于一位名叫玛格丽特·戴霍夫的女性撰写的《蛋白质序列与结构图册》。这本书记载了当时已知的65种蛋白质序列。为了编写这本图册,戴霍夫采用了尖端的计算机技术来解决生物学问题,从而在无形中推动了“生物信息学”这个全新领域的诞生。

前卫的研究方法

1925年3月11日,戴霍夫出生于美国费城。1945年,她以优异的成绩毕业于纽约大学数学系。同年,她进入哥伦比亚大学,在著名化学家乔治·金博尔的指导下攻读量子化学博士学位,用了3年获得了量子化学博士学位。这在当时是非常罕见的事情,因为男性在化学领域占据着垄断地位,只有5%的化学博士学位被授予女性。

在戴霍夫就读期间,哥伦比亚大学是美国计算技术的重镇,拥有美国历史最悠久的计算机实验室,其中包括沃森科学计算实验室。在第二次世界大战的最后几个月里,沃森科学计算实验室是盟军的计算机中心。战争结束后,它成为首批超级计算机的开发地,“阿波罗计划”所使用的超级计算机就是在这里诞生的。……

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