邸金娜,刘敬禹,张 莉
(锦州医科大学附属第三医院呼吸内科,辽宁 锦州 121001)
肺癌大多起源于支气管黏膜上皮,也称支气管肺癌。据统计,2019年全球有1810万新增癌症患者,我国癌症患者约380.4万例,其中肺癌发病率为11.8%,病死率为18.4%[1]。而非小细胞肺癌(Non-small-cell lung cancer,NSCLC)可占所有肺癌病例的83%,其5年相对生存率仅为18%[2-3]。近年来中药在预防及治疗NSCLC上显现出独特优势,并逐渐受到研究者的重视。人参作为常用的中药材,具有大补元气、复脉固脱、补脾益肺等功效,临床上应用广泛。大量研究[4-6]表明,人参可通过抑制细胞增殖、诱导细胞周期阻滞、促进细胞凋亡、影响细胞分化等达到治疗NSCLC的目的。但因人参成分复杂,对于其治疗NSCLC的药效物质基础及机制,目前仍不明确。基于网络药理学方法,本研究构建“成分-靶点-疾病-通路”蛋白相互作用(PPI)网络,预测人参治疗NSCLC核心靶点及机制,为人参治疗NSCLC提供参考。
1.1 人参活性成分收集 以“人参”为检索词,从中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP,http://tcmspw.com/tcmsp.php)对所有药物成分数据库进行筛选和构建。筛选条件:口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18[7]。搜索中医药整合药理学网络计算研究平台(TCMIP,http://www.tcmip.cn/TCMIP/index.php)整合药物潜在活性成分和相应靶标信息,获得人参活性成分-靶点数据,导入Cytoscape软件,建立人参-靶点PPI网络。
1.2 NSCLC-靶点PPI网络构建 利用比较毒物遗传学数据库(CTD,http://ctd.mdibl.org)、基因名片数据库(Gene Cards,https://www.genecards.org)和疗效药靶数据库(TTD,http://db.idrblab.net/ttd/),以关键词“non-small-cell carcinoma”检索获取NSCLC基因。通过Draw Venn Diagram(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/)将人参和NSCLC基因进行整合,选取交集基因导入Cytoscape软件建立NSCLC-靶点PPI网络。
1.3 人参-靶点-NSCLC PPI网络构建 利用Cyto NCA插件对交集网络进行分析[8],建立人参-靶点-NSCLC PPI网络。……