基于网络药理及分子对接技术对人参治疗非小细胞肺癌作用机制研究

2021-06-18 09:44:08邸金娜刘敬禹
陕西医学杂志 2021年6期
关键词:信号分析

邸金娜,刘敬禹,张 莉

(锦州医科大学附属第三医院呼吸内科,辽宁 锦州 121001)

肺癌大多起源于支气管黏膜上皮,也称支气管肺癌。据统计,2019年全球有1810万新增癌症患者,我国癌症患者约380.4万例,其中肺癌发病率为11.8%,病死率为18.4%[1]。而非小细胞肺癌(Non-small-cell lung cancer,NSCLC)可占所有肺癌病例的83%,其5年相对生存率仅为18%[2-3]。近年来中药在预防及治疗NSCLC上显现出独特优势,并逐渐受到研究者的重视。人参作为常用的中药材,具有大补元气、复脉固脱、补脾益肺等功效,临床上应用广泛。大量研究[4-6]表明,人参可通过抑制细胞增殖、诱导细胞周期阻滞、促进细胞凋亡、影响细胞分化等达到治疗NSCLC的目的。但因人参成分复杂,对于其治疗NSCLC的药效物质基础及机制,目前仍不明确。基于网络药理学方法,本研究构建“成分-靶点-疾病-通路”蛋白相互作用(PPI)网络,预测人参治疗NSCLC核心靶点及机制,为人参治疗NSCLC提供参考。

1 资料与方法

1.1 人参活性成分收集 以“人参”为检索词,从中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP,http://tcmspw.com/tcmsp.php)对所有药物成分数据库进行筛选和构建。筛选条件:口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18[7]。搜索中医药整合药理学网络计算研究平台(TCMIP,http://www.tcmip.cn/TCMIP/index.php)整合药物潜在活性成分和相应靶标信息,获得人参活性成分-靶点数据,导入Cytoscape软件,建立人参-靶点PPI网络。

1.2 NSCLC-靶点PPI网络构建 利用比较毒物遗传学数据库(CTD,http://ctd.mdibl.org)、基因名片数据库(Gene Cards,https://www.genecards.org)和疗效药靶数据库(TTD,http://db.idrblab.net/ttd/),以关键词“non-small-cell carcinoma”检索获取NSCLC基因。通过Draw Venn Diagram(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/)将人参和NSCLC基因进行整合,选取交集基因导入Cytoscape软件建立NSCLC-靶点PPI网络。

1.3 人参-靶点-NSCLC PPI网络构建 利用Cyto NCA插件对交集网络进行分析[8],建立人参-靶点-NSCLC PPI网络。……

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