禾谷炭疽菌内吞相关蛋白找寻及其生物信息学

2021-06-24 02:23:56韩长志
科学技术与工程 2021年13期
关键词:分析

覃 悦,韩长志

(1. 西南林业大学生物多样性保护学院,昆明 650224; 2. 西南林业大学研究生院,昆明 650224; 3. 云南省森林灾害预警与控制重点实验室,昆明 650224)

受体介导的内吞作用(receptor-mediated endocytosis)是生物体中大多数细胞实现物质内吞的重要途径之一[1-2],该作用是由直径约100 nm小泡产生介导的,小泡具有由胞浆蛋白网格蛋白组成的形态特征性被膜[3]。在模式生物真菌研究中,内吞与其细胞的生长、发育以及分化等各个过程密切相关。前人研究表明,模式真菌(酿酒酵母、构巢曲霉等)中含有NPFxD基序的蛋白参与内吞靶向信号过程,该信号在实现含有特征化弗林蛋白酶样蛋白酶Kex2p胞质结构域的嵌合蛋白过程发挥重要作用[4]。同时,真菌的包被网格蛋白囊泡(CCV)广泛存在于细胞中,并形成质膜的区域,该区域可浓缩具有不同受体的大细胞外分子,不同受体则负责配体的低密度脂蛋白、生长因子、转铁蛋白和抗体等受体介导的内吞作用[5],并通过CCV摄取的蛋白质通常具有内吞靶向信号,可直接掺入新囊泡中[6]。

表 1 禾谷炭疽菌中NPFxD基序蛋白的基本信息及获取方法Table1 Basic information and method of obtaining NPFxD motif protein in C. graminicola

禾谷炭疽菌Colletotrichumgraminicola(Cesati)Wilson是一种半活体营养病原菌,主要危害玉米、小麦等农作物[7-9],也可定殖并感染蓝草、黑麦草和羊茅等禾本科植物上,严重危害着禾本科作物的健康生产,影响农业经济的发展。随着该菌全基因组序列的释放[10],前人对其分泌蛋白、G蛋白信号通路蛋白、MAPK(丝裂原活化蛋白激酶)途径蛋白[11]、RGS(G蛋白信号转导调节蛋白)[12]等进行了预测及生物信息学分析,为进一步明确上述蛋白在该病菌致病过程中的功能解析奠定了理论基础。……

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