唐修君,樊艳凤,贾晓旭,葛庆联,陆俊贤,马丽娜,韩 威,高玉时*
(1.中国农业科学院家禽研究所,扬州 225125; 2. 南京农业大学动物科技学院,南京 210095; 3. 江苏省家禽遗传育种重点实验室,扬州 225125)
线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)为动物核外遗传物质,发生变异的机率相对稳定,无遗传重组,具有从母系起源上确定品种间遗传关系的特点,通常能够全面反映种群内和种群间的遗传变异[1],已成为探讨种群遗传结构、系统发育进化及种质鉴定研究的重要研究对象[2-4]。线粒体控制区又称D-环区(D-loop区),是一段非编码区,其进化速率较线粒体其它区域快5~10倍,是研究亲缘关系较近群体的起源进化和种质鉴定理想的分子标记[5-8],目前已成功应用于猪[9-11]、牛[12-14]、羊[15-17]、马[18-20]、驴[21-23]、鹿[24]和鸽[25]等多个物种的遗传多样性和系统发育研究。近年来,在对我国地方鸡种遗传多样性和母系起源方面的研究显示,线粒体D-loop区作为目标位点已逐渐成为研究热点[26-28]。黄勋和等[29]基于线粒体DNA D-loop序列研究了广东省和邻省共12个地方鸡品种间的遗传距离和系统关系,系统评估了其遗传变异水平并追溯了其母系起源。贾晓旭等[30]基于线粒体DNA控制区序列研究了我国华东地区11个地方鸡品种的遗传多样性与亲缘关系,并构建了其与红色原鸡系统发生的邻接树,探讨了11个品种的母系起源。
随着对线粒体基因组序列研究的关注热度越来越高,在探讨基于线粒体DNA的物种遗传多样性和起源进化的同时,对线粒体单倍型(世系)的划分也有相关研究。……