我国荷斯坦青年公牛基因组选择效果分析

苏丁然，彭 朋，闫青霞，陈绍祜，张胜利，李 姣，刘丑生，孙东晓*

(1. 中国农业大学动物科技学院，北京 100193； 2. 中国奶业协会，北京 100192； 3. 全国畜牧总站，北京 100125)

基因组选择是通过覆盖全基因组的高密度单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)标记，并结合大量的后裔测定遗传评估结果来计算个体的基因组估计育种值(genomic estimated breeding value, GEBV)[1-2]。2001年，Meuwissen等[3]首次提出基因组选择(genomic selection, GS)的概念。2006年，Schaeffer[4]基于加拿大荷斯坦牛群体的研究结果表明，通过基因组选择可以节约92%的育种成本。畜禽全基因组高密度 SNP 芯片技术逐渐发展成熟，2007年首款商业化牛50K全基因组SNP芯片问世，由美国Illumina公司研发[5]，由此，基因组选择技术在奶牛育种工作中开始得到应用，并逐步成为重要的奶牛育种策略[6-8]，其中，美国荷斯坦协会于2009年1月首次发布荷斯坦青年公牛的基因组遗传评定结果[9]。2012年，中国农业大学奶牛育种团队及北京奶牛中心、北京首农畜牧、上海奶牛中心、全国畜牧总站和中国奶业协会等单位合作，成功建立了中国荷斯坦牛基因组选择技术平台，被农业部指定为我国荷斯坦青年公牛遗传评定的唯一平台，并开始在全国推广应用[10]。在基因组选择提出之前，后裔测定是评定奶牛种用价值最可靠的方法，但后裔测定存在世代间隔长，育种成本高等缺点。基因组选择相比后裔测定有以下优势：1) 能够捕获与目标性状有关的所有的遗传变异，具有较高的选择准确性(>70%)，高于传统系谱指数估计的可靠性[11-18]，且利用生物学先验信息可以更好地提高基因组选择的可靠性[19-21]。2……