李铭杨,何佳琦,邱爽,于海伟,邬长乐,张军,翟莹
大豆转录因子的生物信息学及干旱胁迫表达分析
李铭杨1,何佳琦1,邱爽1,于海伟1,邬长乐1,张军2,翟莹1
(1.齐齐哈尔大学 生命科学与农林学院,黑龙江 齐齐哈尔 161006;2.黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院,黑龙江 齐齐哈尔 161005)
利用生物信息学的方法对大豆转录因子进行了分析,同时利用实时荧光定量PCR对在干旱胁迫下的表达量进行检测。位于大豆基因组7号染色体上,mRNA编码序列全长1434bp,编码含有477个氨基酸的蛋白质,分子量53.12kDa,等电点5.87,其蛋白序列中含有一个VOZ-domain。预测结果显示,GmVOZ1蛋白是亲水性蛋白,无信号肽,定位在细胞核内。蛋白系统发育分析结果显示,GmVOZ1与苜蓿MtVOZ和拟南芥AtVOZ1亲缘关系较近。启动子序列中含有多个光响应元件、激素响应相关元件和逆境响应相关元件。干旱胁迫处理后,的表达量升高,最高值约为对照组的15倍。上述结果为在大豆抗旱领域的研究提供理论依据。
大豆;转录因子;VOZ;干旱胁迫;表达分析
转录因子又名反式作用因子,存在于所有真核生物中。作为一种DNA结合蛋白,转录因子能够与增强子、启动子等顺式作用元件相互作用,实现激活和抑制目标基因转录的功能[1]。调控转录因子的表达是提高农作物抗性的一种有效方式。维管植物锌指蛋白(Vascular plant one-zinc finger protein, VOZ)是NAC家族中NAM亚族成员。VOZ转录因子家族为高等植物特有,最早被克隆的是拟南芥中的两个成员和。在韧皮部特异性表达,在根部的表达相对较强,它们都与花粉发育相关[2]。……