鲁雁秋,王 静,陈耀凯,李俊刚
抗反转录病毒治疗(antiretroviral therapy,ART)是目前治疗HIV-1感染的最有效手段,也是控制病毒传播的主要措施之一。目前,全球已有2 600万HIV-1感染者正在接受ART[1-2]。然而,随着ART的广泛开展,抗病毒药物耐药问题日益凸显[3]。法国接受ART的感染者随访6年的总体耐药率为11.7%[4]。我国山东省接受ART满1年人群耐药率达6.2%[5],云南、广西和河南三个省份报道的HIV-1 耐药率约为7.1%[6]。迄今尚未见重庆地区HIV-1耐药情况的大样本研究。为此,本课题组对2015年5月—2020年6月在重庆市公共卫生医疗救治中心接受一线ART且发生病毒学失败的HIV感染者进行回顾性分析,以了解本地区HIV-1耐药情况。
2015年5月—2020年6月,本中心共收治HIV-1感染者3 305例,其中接受ART 1年以上且病毒载量大于1 000 拷贝/mL者为348例。所有348例病例均留取EDTA-K2抗凝血浆5mL,进行HIV-1病毒载量检测、基因扩增、耐药分析和基因亚型分析。
1.2.1 HIV-1病毒载量检测 采用全自动实时荧光定量检测仪(COBAS Taq-Man48,德国罗氏公司产品),定量检测血浆HIV-1 RNA水平(最低检测下线值为20拷贝/mL)。
1.2.2 HIV-1基因扩增和耐药分析 血浆标本采用ViroSeq HIV-1基因型耐药检测试剂盒(美国Abbott公司产品)进行HIV-1 RNA提取,经实时荧光定量(RT)-PCR扩增出包含全部蛋白酶基因和三分之二反转录酶基因的片段(长度为1.8 kb),然后以扩增片段为模板采用7条引物分别测序;用ViroSeq HIV-1耐药分析软件(The ViroSeq HIV-1 Genotyping System Software)对7个引物测得序列进行拼接、编辑以及对拼接序列进行突变确认,再把拼接序列同HIV-1参考毒株(HXB-2)序列进行比对分析,以此来确认样本的突变位点;最后,采用ViroSeq HIV-1耐药分析软件选择合适的数学模型对这些突变位点进行分析并生成耐药报告。……