中药网络药理学研究流程及代表性数据库工具△

王凤雪，高宇，刘海波

中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所，北京 100193

中药是在传统医药理论的指导下，经过加工炮制后应用于临床的药物，包括植物药、动物药和矿物药。中药在中国及日本、韩国等东亚和东南亚地区应用十分广泛，在预防、治疗疾病，养生等方面发挥着重要的作用。虽然中药的应用广泛，但由于其“多成分、多靶点”的作用特点，在分子水平上通过实验手段阐明其作用机制仍存在很大的技术困难，这一情况严重阻碍了中药的现代化研究进程。网络药理学方法的引入使这一困境得到了很大的改观。网络药理学由英国药理学家Hopkins于2007年提出，该学科以系统生物学思想和数据为基础，通过网络方法解析药物、靶点和疾病之间的相互关系，根据分析结果研发和设计具有多种药理学效应的药物[1]。网络药理学属于系统生物学、生物信息学和高通量组学分析的药理学分支学科[2-4]。近年来，网络药理学被广泛应用于中药方剂及单体对疾病的药理作用及其机制研究[5-7]、复方新适应证发现[8]和网络毒理学研究[9]等。以“network pharmacology/网络药理学”为主题在PubMed和中国知网(CNKI)上进行检索，近10年来关于网络药理学的文章发表情况见图1。由图1可以看出，网络药理学研究呈现逐年上升的趋势。

图1 近10年网络药理学相关文章发表情况

本文以网络药理学研究流程为基础，重点介绍关于中药化合物收集、化合物和疾病靶点预测、基因富集分析等技术环节的代表性数据库，对各数据信息平台的特点进行比较，为后续中药网络药理学的研究提供参考。……