1株分离自猩红热患儿的耐多药嵴链球菌全基因组测序及比较基因组分析

黄银燕，赵 刚，贾庆军，吴亦斐，程庆林，王 乐，陆 敏，李清春，谢 立

猩红热(Scarlet Fever)是由能产生红疹毒素的A组β溶血性链球菌(beta-haemolytic group A streptococcus isolates, GAS)，也称化脓链球菌(S.pyogenes)感染所引起的一种急性呼吸道传染病，是我国法定的乙类传染病之一[1]。有研究表明嵴链球菌一般分离于健康或者龋齿患者的牙菌斑，有利于延缓龋齿的发生[2]，而从猩红热患者咽拭子分离到嵴链球菌报道较少[3]。本课题组前期研究从确诊的猩红热患儿咽拭子分离到一株嵴链球菌S22，并且未分离到化脓链球菌[3]。本文对S22进行全基因组测序分析，并将其与NCBI基因组数据库中的嵴链球菌和部分具有代表性的链球菌基因组进行比较基因组学研究，从基因组的角度探讨嵴链球的致病机理、耐药机制及其与其他链球菌在基因水平的差异和进化关系，探索嵴链球菌与猩红热之间的关系，为临床用药和疾病防控等提供一定参考依据。

1 材料与方法

1.1 菌株来源 菌株S22分离自杭州市儿童医院猩红热患儿咽拭子[3]。细菌药物敏感实验采用纸片扩散法测定S22对红霉素、罗红霉素、阿奇霉素、泰利菌素、螺旋霉素、林可霉素、链阳霉素B、四环素、链霉素、庆大霉素、卡那霉素、西索米星、妥布霉素、阿米卡星、奈替米星和杆菌肽。将单菌落接种于含 5%牛血清的脑心浸液培养管中，37 ℃孵育过夜。调整菌液浊度为0.5 麦氏比浊浓度，作1∶1 000 倍稀释。以无菌棉拭子蘸取稀释液均匀涂布在MH琼脂培养基表面，用无菌镊子贴上各药敏纸片并轻压，两纸片之间距离以 2～3 cm 为宜。……