陕西省屠宰生猪PCV2检测及其遗传变异分析

罗弼豪，徐浩，罗丽华，范昱鑫，杨卓霖，王月婷，季天润，康煜坤，韩雪英*，郭抗抗*

(1. 西北农林科技大学动物医学院，陕西 杨凌 712100；2. 深圳海关动植物检验检疫技术中心，广东 深圳 518045)

猪圆环病毒2型(porcine circovirus type 2，PCV2)于1991年在加拿大被首次报道，它不仅是断奶仔猪多系统衰竭综合征的主要病原，而且与猪皮炎与肾炎综合征、猪呼吸道综合征、增生性坏死性肺炎和先天性颤抖病及繁殖障碍综合征等有重要关联。2000年，由该病毒引发的相关猪病在我国首次报道[1]，现如今PCV2已在我国猪群中普遍流行并严重危害我国生猪养殖和贸易的发展[2]。因此，加强生猪猪群中PCV2尤其是其亚型的监测和防控显得尤为迫切。

PCV2为无囊膜的单股环状DNA病毒[3]，其病毒基因组全长1 767 bp，含11个开放阅读框(open reading frame，ORF)，以编码的Cap蛋白ORF2最为重要。Cap蛋白大小约27.8 ku，是介导PCV2进入宿主细胞的衣壳(结构)蛋白，同时也是PCV2全基因组中变异程度最高的蛋白。鉴于Cap蛋白的重要性和特殊性，ORF2毫无疑问成为了研究PCV2整个基因组变异的首要靶基因[4]。

为深入掌握陕西部分地区屠宰生猪PCV2的流行和遗传变异规律，本研究对2018—2019年采自陕西部分地区屠宰生猪的血液样品进行PCV2检测，对部分阳性样品ORF2基因进行扩增测序、序列比对及遗传变异分析，通过探讨上述地区PCV2毒株流行和遗传变异情况，进而为该地区PCV2感染的针对性防治提供理论依据。

1 材料与方法

1.1 样品采集和来源

2018年10月—2019年3月，课题组共对陕西省咸阳和杨凌的生猪屠宰企业进行了15次采样(每次20份)，合计采集血样300份。……