非洲猪瘟病毒Pig/HLJ/2018株CP2475L编码蛋白pp220的生物信息学分析

2021-08-10 08:08:22曹乾大戴碧红曹雪莲
猪业科学 2021年7期
关键词:分析

曹乾大 ,戴碧红 ,曹雪莲 ,杨 旸

(1.富顺县动物疫病预防控制中心,四川 自贡 643200;2.内江职业技术学院,四川 内江 641200;3.雁江区动物疫病预防控制中心,四川 资阳 641300)

非洲猪瘟自2018年传入中国以来,以极快的速度在国内传播,给中国生猪养殖业造成了数千亿元的经济损失,并且这一数字随着疫情形势在进一步扩大,对整个养殖环境的冲击和经济的深远影响非常之大。非洲猪瘟病毒的生存能力很强,一旦在一个区域出现,将会形成定植,所以如何防止、净化、根除非洲猪瘟是我国动物疫情防控的重中之重。非洲猪瘟的病原是非洲猪瘟病毒(Africa Swine Fever virus,ASFV),CP2475L 基 因 是非洲猪瘟病毒基因组中最大的一个基因,它是参与病毒核衣壳形成的重要基因,其编码蛋白为pp220蛋白(polyprotein 220,多聚蛋白),经裂解加工后形成病毒主要的结构蛋 白 p150、p37、p34和 p14, 抑制CP2475L基因的表达将会导致病毒核衣壳和DNA的部分缺失,推测CP2475L基因可能具有衔接病毒核衣壳和囊膜的功能,pp220可能作为一个蛋白支架的作用,连接核衣壳和外部包膜[1-2]。pp220对ASFV另一个多聚蛋白前体pp62的加工有重要作用,pp62的加工需要pp220表达的核心产物参与才能进行,而pp220和pp62这两个前体的加工又依赖于ASFV主要衣壳蛋白p72的表达,当p72的表达被敲除后,pp62和pp220会形成一个拉链状细长的膜结合蛋白结构,而pp220和pp62经加工之后的成熟产物共占ASFV粒子蛋白质量的30%左右,是核衣壳的重要组成部分,因此,多聚蛋白pp220和pp62对ASFV组装成熟有重要作用[3-4]。目前对CP2475L基因编码蛋白pp220的研究数据较少,文章以非洲猪瘟病毒Pig/HLJ/2018中国分离株为对象,从生物信息学角度对CP2475L基因编码的pp220多聚蛋白进行分析,为非洲猪瘟病毒的研究补充一些基础数据。……

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