鼠伤寒沙门菌sRNA GcvB与靶基因的作用机理分析

潘 永，杨 阳，段世宇，杨 琦,3*

(1.贵州大学 动物科学学院，贵州 贵阳 550025；2.贵州大学 动物疫病研究所，贵州 贵阳 550025；3.贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室，贵州 贵阳 550025)

sRNA(small RNA)是长度为40～500 nt的主要调控基因转录后表达的短非编码RNA，在原核生物中广泛存在，此前相关研究主要集中于大肠杆菌和沙门菌[1]。多项研究结果表明，sRNA调控着多种基因，这些基因编码与细菌生理、代谢、应激反应和群体感应等有关过程中涉及的蛋白质[2-5]。许多sRNA能够调节多种靶mRNA，一种靶mRNA可受多个sRNA调节，从而形成了一个基于sRNA的复杂网络，体现了它们在基因转录后调控中的重要作用。sRNA降低了细菌代谢所消耗的能量并提供了更紧密，更快速的基因调节，可帮助细菌适应新环境。sRNA GcvB是一段仅有206个核苷酸组成的短非编码RNA分子，在细菌中比较保守，大肠杆菌和沙门菌gcvB基因RNA序列相似度高达95%。研究表明，GcvB主要调控沙门菌ABC转运蛋白的表达[6]。GcvB通过3个特殊保守单链核苷酸序列R1、R2或R3与靶mRNA对应序列完全或部分碱基互补配对，从而抑制或促进mRNA的翻译[7-9]。此前，仅探明GcvB直接调控30余种mRNA，相信还有大量GcvB靶基因未被挖掘。MIYAKOSHI等[10]最近在研究与鼠伤寒沙门菌(Salmonellatyphimurium LT2，STM LT2)sRNA GcvB产生拮抗作用的mRNA 海绵SroC时，通过微阵列分析筛选到部分受GcvB调控的基因，但这些基因是否受GcvB直接调控目前尚未验证。

研究表明，GcvB在细菌对数期早期表达量最高，随着生长周期往后的推移，表达量水平下降直至稳定期几乎检测不到，因此本研究仅分析各基因转录水平在STM LT2对数早期时的变化[11]。……