高、低产蛋量新疆伊犁鹅性腺轴转录组分析：基因结构分析与新基因发掘注释

吴盈萍，古力娜·巴克，李海英，赵晓钰，马 晨，姚莹莹，曹 妍，梅志勇，潘 璐

（新疆农业大学动物科学学院，新疆乌鲁木齐 830000）

新疆伊犁鹅（Yili Goose）是新疆优良、珍稀的地方禽种，是我国唯一由灰雁（Anser anser）驯化而来的中小型家鹅品种[1]。新疆伊犁鹅的驯化历史较短、驯化程度较低，其具有一定的短距离飞行能力，耐粗饲、抗病力强、抗寒耐热且肉质优良，于2000 年8 月被农业部（现为“农业农村部”，下同）列入第一批国家级畜禽品种资源保护名录[2]。但新疆伊犁鹅的产蛋量较低，成年母鹅平均年产蛋量仅为8～12 枚[3]，同时其就巢性很强，严重制约了地方鹅品种产蛋性能的提高。

转录组在研究畜禽生长发育及生理活动中发挥重要作用，也是表型关联研究的重要方法。随着转录组测序技术的快速发展，RNA-seq 技术已广泛应用于检测新的转录本[4]、差异基因筛选、可变剪接[5-7]、基因结构优化[8-9]以及SNP 筛查[10-11]等相关研究。张蕾[12]等人利用转录组测序技术对高邮鸭双黄蛋高、低产组卵巢组织进行测序，对测序数据进行质控和注释，筛选与高邮鸭双黄蛋产蛋性能相关的SNP 位点，在所覆盖的基因组数据中，检测到位于基因外显子区域的108 260～116 478 个SNP 位点，转换类型总数极显著高于颠换类型总数（P＜0.01）。韩坤鹏[13]等通过转录组测序技术对京海黄鸡卵巢进行测序分析，基于所选参考基因组序列，共发掘4 431 个新基因，其中1 809 个新基因得到注释。本研究应用RNA-seq 技术对高、低产蛋量伊犁鹅性腺轴组织进行SNP 查找、可变剪切筛查、基因结构优化以及新转录本预测，为进一步解析产蛋量调控的分子机制提供理论依据。……