帕金森病的生物信息学分析及潜在治疗中药的预测

赵佳佳 木尼热·艾海提 张宇洁 杨俊玲 叶红霞 许 忠

乌鲁木齐市中医医院药学部，新疆乌鲁木齐 830000

帕金森病（Parkinson disease，PD）是一种神经衰退性疾病，通常表现为运动迟缓，自主活动受限，集中体现在感觉、认知和睡眠障碍等方面[1]。此病通常发生在中脑黑质纹状体区域，主要是多巴胺缺失[2]，目前，发病原因和机制尚不清楚。临床西药治疗主要应用左旋多巴，使用该药后虽然能减轻患者的临床症状，但并不能从根源上阻止神经退化，且有较大的副作用[3]。近年来，中药及其复方制剂在治疗PD的神经保护方面开展了大量研究，并获得了成效[4-6]，已成为PD 防治药物开发的热点。

但是中医临床用药多是个人经验总结，虽然疗效显著，但对PD的治疗机制并不能明确解释。因此，本研究运用生物信息学分析，筛选出PD 关键致病基因和信号通路，同时预测潜在治疗中药，为PD的发生机制和中药治疗提供参考依据。

1 资料与方法

1.1 PD 差异表达基因的获取

通过GEO 数据库检索PD 患者和健康人的基因表达信息，运用GEO2R 分析PD 组和健康对照组间的基因差异，将P <0.05，FC>1 倍的基因纳入差异表达基因，在GeneCards 数据库，检索PD 相关基因，两个结果中共有基因为PD的显著差异基因。

1.2 蛋白质-蛋白质相互作用（protein-protein interactions，PPI）网络的构建

用PPI 网络分析基因或蛋白间的相互作用，通过String 数据库构建PPI 网络，将得到的PPI 信息导入Cytoscape 软件，得到PPI 网络图可视化。

1.3 靶点功能通路注释

经过GO 和KEGG 分析可知差异基因功能，进而分析其在疾病中的作用机制。将差异基因导入Metascape 数据库，选定物种为“homo sapiens”，校正名称，所有的名称都必须使用官方名称。……