m6A RNA甲基化调节因子与肝细胞癌预后的关系

裴晓健，贾宝学，田晓彤

山东第一医科大学第三附属医院内一科，济南250031

肝细胞癌（HCC）是原发性肝癌中最常见的病理类型，因其早期诊断困难、病情进展迅速，预后较差［1］。迄今为止，HCC的发病机制仍未完全阐明，其演变可能是由遗传学和表观遗传学共同改变所致。N6-甲基腺嘌呤（m6A）是真核生物mRNA中含量最丰富的甲基化修饰形式［2-3］。m6A RNA甲基化类似于DNA甲基化和组蛋白修饰，由“编写器”、“阅读器”和“擦除器”等甲基化调节因子动态调节共同完成［3］。这些m6A RNA甲基化调节因子与肿瘤干细胞自我更新和肿瘤细胞增殖、分化以及放化疗敏感性密切相关［4］。但目前m6A RNA甲基化调节因子在HCC中的作用及其对预后的影响尚未得到证实。为此，本研究观察了m6A RNA甲基化调节因子在HCC中的表达，并探讨其与预后的关系。现报告如下。

1 资料与方法

1.1 数据下载与资料提取 从美国国家癌症研究所基因组数据共享中心（https：//portal.gdc.cancer.gov/）下载HCC样本和正常对照样本的RNA-seq转录组数据，筛选其FPKM格式数据。同时，收集HCC样本的临床病理资料。排除性别、年龄、WHO病理分期、病理分级等临床病理资料不完整样本。

1.2 筛选m6A RNA甲基化调节因子 十三种m6A相关基因被认为是m6A RNA甲基化调节因子［5］，并且在胶质瘤中被证实［6］，但在HCC中尚未被证实。从RNA-seq转录组数据中获取十三种m6A RNA甲基化调节因子表达数据，比较HCC样本和正常对照样本m6A RNA甲基化调节因子表达。

1.3 十三种m6A RNA甲基化调节因子的相互作用 应用STRING数据库构建十三种m6A RNA甲基化调节因子的蛋白质—蛋白质相互作用（PPI）网络，并用R软件中的“corrplot”包分析其相关性。……