我国鸡传染性支气管炎病毒的遗传变异和进化分析

李玉杰 盛媛 魏秀丽 徐恩民 吴静 刘娜 马秀丽

摘 要：本研究测定了2020年以来本实验室从不同地区分离的44个IBV毒株的S1基因序列，并与参考株序列进行比较分析。结果发现分离的44个IBV毒株共占据5个分支。其中：第一分支为QX型，包括25个分离株，QX型分离株又分为ClusterⅠ亚分支（7个）和ClusterⅡ亚分支（18个）;第二分支为4/91型，包括12个分离株;第三分支为LDT3型，包括3个分离株;第四分支为Mass型，包括2个分离株;第五分支为TW型，包括2个分离株。从毒株遗传进化分析结果可以看出，QX型仍是我国IBV流行的主要基因型。

关键词：传染性支气管炎病毒;S1基因;遗传变异;进化变异

中图分类号：S858.31 文献标识码：B文章编号：1673-1085（2021）6-0005-05

传染性支气管炎（IB）是鸡的一种急性、高度接触性的病毒性呼吸道疾病，在国内流行甚广。传染性支气管炎病毒（IBV）属于冠状病毒科冠状病毒属的成员之一，其基因组为单股线状正链RNA，含有3种主要结构蛋白，即纤突蛋白S、膜蛋白M和核蛋白N。S1基因是IBV基因组中最易发生变异的部位，其编码蛋白可诱导机体产生IBV特异的中和抗体和血凝抑制抗体，S1蛋白在进化上比M蛋白和N蛋白都表现活跃，因此可不断导致IBV新的血清型、亚型和变异株的产生，致使IBV疫苗免疫失败，给鸡传染性支气管炎的防制带来新的困难。

由于传染性支气管炎病毒血清型和变异株众多，各型之间无交叉反应或交叉反应差。因此，对于传染性支气管炎的防控，首先需明确当地流行传染性支气管炎的血清型和变异株。从分子水平揭示近年来IBV的变异情况以及不同毒株之间的进化关系，对我国今后开展传染性支气管炎的监测和综合防控具有重要的指导意义。……