基于网络药理学及斑马鱼模型的瓜蒌薤白半夏汤干预慢性阻塞性肺疾病的作用机制研究

2021-09-06 03:23:46谈晓莹冯伟萌武文星刘嘉庆宿树兰尚尔鑫张黄琴段金廒
中草药 2021年17期
关键词:数据库

谈晓莹,李 丹,刘 培,冯伟萌,武文星,刘嘉庆,宿树兰,郭 盛,尚尔鑫,张黄琴,段金廒

• 药理与临床 •

基于网络药理学及斑马鱼模型的瓜蒌薤白半夏汤干预慢性阻塞性肺疾病的作用机制研究

谈晓莹,李 丹,刘 培*,冯伟萌,武文星,刘嘉庆,宿树兰,郭 盛,尚尔鑫,张黄琴,段金廒*

南京中医药大学 江苏省方剂高技术研究重点实验室,江苏省方剂研究重点实验室,江苏省中药资源产业化过程协同创新中心,中药资源产业化与方剂创新药物国家地方联合工程研究中心,江苏 南京 210023

基于网络药理学方法和斑马鱼模型探讨瓜蒌薤白半夏汤干预慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmoriary disease,COPD)的潜在作用机制。运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药百科全书数据库(ETCM)、中医药综合数据库(TCMID)以及国内外相关文献检索瓜蒌薤白半夏汤的主要活性成分,通过TCMSP和SwissTargetPrediction数据库预测靶点;通过GeneCards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和TCMSP数据库获取COPD相关靶点,并采用交集法筛选出与瓜蒌薤白半夏汤活性成分作用的共同靶点。运用Cytoscape 3.7.1软件构建“中药-活性成分-靶点”网络,通过String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络;通过DAVID数据库对共有基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;借助斑马鱼炎症模型对筛选的靶点进行实验验证。瓜蒌薤白半夏汤共筛选出成分955个,潜在活性成分106个,核心活性成分如芹菜素、茴香酸、美迪紫檀素、金圣草黄素、香叶木素等74个,对应靶点1134个;……

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