MRPL12在肺腺癌中的表达和预后分析

2021-09-09 08:09:42许明芳
上海交通大学学报(医学版) 2021年8期
关键词:分析

熊 雷,易 茜,许明芳,陈 健

1.重庆市渝北区人民医院门诊手术室,重庆 401120;2.重庆佑佑宝贝妇儿医院儿内科,重庆 401120;3.陆军特色医疗中心肿瘤科,重庆 400042

在中国乃至全世界肺癌都是发病率最高的癌症,2018年全球新增肺癌病例约210万例,死亡约176万例[1-2]。因此,寻找有效的早期检测和预后判断的生物标志物对于肺癌的预防和治疗有着重要的意义[3]。线粒体功能障碍是大多数肿瘤的特征之一,近年来以线粒体核糖体为靶点治疗癌症已成为研究热点[4-7]。线粒体核糖体蛋白L12(mitochondrial ribosomal protein L12,MRPL12)是线粒体核糖体39S大亚基的一个组成蛋白,调节核糖体mRNA的翻译[8]。另外,它还能直接与线粒体RNA聚合酶结合调节线粒体基因表达,并且与细胞增殖密切相关[9-10]。MRPL12蛋白的编码基因位于染色体17q25[8],并且此区域的基因在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)中转录普遍增强[11]。关于MRPL12表达与癌症的关系目前罕见文献报道。本研究主要分析MRPL12在LUAD中的表达和与预后的关系,并探讨MRPL12在LUAD中可能参与的生物学过程,为临床治疗和药物研发提供理论依据。

1 材料与方法

1.1 差异表达分析

通过肿瘤浸润性免疫细胞分析数据库TIMER2.0(https://cistrome.shinyapps.io/timer/)的Gene_DE模块分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中MRPL12在肿瘤和相邻正常组织之间的差异表达,采用Wilcoxon秩和检验计算统计显著性[12]。再利用GEPIA(gene expression profiling and interactive analyses)交互式网站服务器(http://gepia2.cancer-pku.cn/#index)验证,差异基因检验方法选择方差分析(analysis of variance,ANOVA)[13]。综 合2个 分 析 平 台,筛 选MRPL12差异表达可能性高的癌症类型。

1.2 生存分析

利用Sangerbox生物信息分析平台[13](http://sangerbox.com/Gene?search1=MRPL12&page=1)对MRPL12差异表达的癌症类型进行预后生存分析,采用Cox回归模型……

登录APP查看全文

猜你喜欢
分析
禽大肠杆菌病的分析、诊断和防治
隐蔽失效适航要求符合性验证分析
电力系统不平衡分析
电子制作(2018年18期)2018-11-14 01:48:24
电力系统及其自动化发展趋势分析
经济危机下的均衡与非均衡分析
对计划生育必要性以及其贯彻实施的分析
现代农业(2016年5期)2016-02-28 18:42:46
GB/T 7714-2015 与GB/T 7714-2005对比分析
出版与印刷(2016年3期)2016-02-02 01:20:11
网购中不良现象分析与应对
中西医结合治疗抑郁症100例分析
伪造有价证券罪立法比较分析