刘 桦,刘妙妙,邓豪余,赵雅洁,李 灿
(中南大学湘雅医院核医学科,长沙 410008)
甲状腺癌是一种常见的内分泌系统恶性肿瘤[1,2],其发病率呈逐年上升的趋势[3,4]。甲状腺癌的不同阶段具有不同的分子特征[5-7],探索甲状腺癌相关因子,用以评估甲状腺癌患者疾病风险程度,对制定个性化和更有效的诊断和治疗策略不可或缺。
随着高通量测序和基因芯片技术的发展,越来越多的研究表明,基于甲状腺癌中差异基因(Differentially Expressed Genes,DEGs)表达水平的特征,在预测甲状腺癌患者预后中具有很大的潜力[8-10]。本研究通过分析来自基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)和癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中的数据集,筛选甲状腺癌相关DEGs。随后,进行LASSO分析并构建了甲状腺癌相关DEGs组成的风险模型,同时建立甲状腺癌相关Nomogram图预测疾病转归,观察甲状腺癌相关DEGs组成的风险模型与甲状腺癌患者总体生存期的关系,为甲状腺癌患者预后预测提供一个潜在选择。
1.1 芯片数据的选择与分析基于GEO数据库中甲状腺癌相关芯片(GSE35570、GSE33630、GSE29265、GSE3467、GSE5364和GSE58545),分析甲状腺癌表达谱,然后筛选甲状腺癌相关DEGs。随后结合Kaplan-Meier生存分析和TCGA数据库分析,筛选与甲状腺癌患者生存期显著相关的DEGs。
1.2 DEGs组成的风险模型分析通过LASSO回归分析甲状腺癌患者生存相关DEG,最终获得甲状腺癌患者生存相关DEG组成的风险模型。
1.3 甲状腺癌DEGs组成的风险模型预测能力分析通过Kaplan-Meier生存分析和单因素多因素Cox风险回归分析,检测甲状腺癌DEGs组成的风险模型得分对甲状腺癌患者预后总体生存期的预测能力。……