张全芳 姜明松 陈峰 朱文银 周学标 杨连群 徐建第
山东省水稻品种(系)的遗传多样性分析
张全芳1姜明松2陈峰2朱文银2周学标2杨连群1徐建第2
(1山东省农业科学院农作物种质资源研究所,250100,山东济南;2山东省农业科学院湿地农业与生态研究所,250100,山东济南)
利用全自动DNA分析仪荧光SSR-PCR技术和农业行业标准《水稻品种鉴定技术规程SSR标记法(NY/T1433-2014)》中公布的48对SSR引物,对山东省育成和审定的48个水稻品种(系)进行遗传多样性分析。结果表明,有40对SSR引物在48个品种(系)间表现多态性,多态率为83.3%。检测到等位基因133个,每对引物的等位基因数变幅为1~7个,平均3.32个。SSR引物的多态性信息量(PIC)变化范围为0.0384~0.7333,平均值0.2560。标记指数(MI)的变化范围在0.08~5.13,平均值0.93。48个水稻品种(系)间的遗传相似系数(GSC)在0.6390~0.9859之间,平均值0.7800,89.6%品种(系)的GSC在0.7189~0.9859之间,亲缘关系较近;以GSC为基础,按UPGMA方法在阈值0.75处将48个品种(系)划分为4大类群。由此可见,山东省育成和审定的水稻品种(系)遗传多样性不够丰富,品种(系)间的亲缘关系较近,需要进一步拓宽亲本选择范围,扩大遗传背景。
水稻;SSR标记;遗传多样性;聚类分析
山东水稻属华北单季稻作带,是重要的高产高效作物和生态作物,种植历史悠久。1949年以来,山东水稻品种大致经过4次大的更新[1]。1949-1959年初种植紫皮旱稻和竹竿青等地方品种;1960-1979年主要种植引进的农垦57、桂花黄、农垦39和农垦40等品种;1980-1999年为引种和育种结合时期,主要种植金南风、京引119和日本晴等引进品种和鲁粳1号、临稻1号、临稻2号、鱼农1号和鲁香粳2号等自育品种;……