肝癌靶点的筛选与验证

王丽萍，田振波，唐旭清

（江南大学理学院，无锡 214122）

引 言

肝癌是临床上一种常见的消化道恶性肿瘤，具有较高的发病率和死亡率，在恶性肿瘤中分别处于第6 位和第3 位［1‑2］。肝癌的发生和发展是多个分子（基因或蛋白质）协同作用的结果［3］，是一个复杂的生物过程，一般可以分为4 个阶段：早期亚临床期、亚临床期、中期和晚期。早期患者没有明显的症状，随着病情的逐渐加重，会出现肝区疼痛、消瘦、乏力等症状，中晚期可能会出现恶液质，全身多脏器发生转移。肝癌总的病程大约为两年半，其中有两年时间可能都是出于没有症状的早期阶段，所以大部分肝癌患者确诊时已是晚期，从而导致治疗效果欠佳［4］。近年来索拉菲尼开辟了一种新的靶向药物治疗方法，但是长期使用药物治疗容易产生耐药性［5］，所以需要发现新的靶点、开发新药物。高通量基因芯片技术的快速发展可以从基因组或转录组水平探索疾病的发生、发展过程，使用GEO（Gene expression omnibus）数据库提供的大量和疾病相关的基因表达谱信息［6］，可以寻找疾病关键基因［7］以及研究特异的分子标志物。

本文首先对肝癌组织和癌旁组织的基因表达谱数据做差异表达分析，筛选差异表达基因；其次对差异表达基因做GO（Gene ontology）功能分析和KEGG（The Kyoto encyclopedia of genes and genomes）通路分析，取同时显著富集的基因作为目标基因；然后通过网络分析寻找目标基因的相互作用关系，寻找高相互作用的关键基因；最后对关键基因进行生存分析验证和文献验证。……