子痫前期相关miR-23b-5p靶基因的预测及生物信息学分析

2021-09-26 12:25:56涂成城陈红波
南昌大学学报(医学版) 2021年4期
关键词:信号分析研究

涂成城,陶 峰,储 斌,陈红波

(安徽医科大学附属妇幼保健院妇产科,合肥 230001)

子痫前期是一种妊娠特异性疾病,严重影响母婴健康,是导致孕产妇及围产儿死亡的第二大原因[1]。子痫前期是一种多因素、多机制及多通路致病的疾病,现公认为其病理起源于胎盘,但其具体机制仍未阐明[2-3]。自2007年PINELES等首次公开证明子痫前期及正常孕妇胎盘组织中存在差异表达的miRNA以来,更多学者开始关注并研究差异表达的miRNA在子痫前期发病机制中的调控作用[4-5]。

miRNA是一类天然存在的小型非编码RNA,其可在转录后水平上调节基因的表达,参与如组织发育、分化、增殖、维持稳态及细胞凋亡等生命活动的各个方面[6]。目前的研究[7]显示,miRNA与子痫前期的发生发展有着密切联系,调节常见的诸如滋养细胞侵袭、内皮细胞凋亡及炎性反应等信号通路。

有学者[8]对子痫前期及正常对照组胎盘脐血miRNA表达谱进行高通量测序分析,发现子痫前期组miR-23b-5p相较于正常对照组表达显著下降,并推测miR-23b-5p可能参与了子痫前期的发病过程。本研究在既往研究的基础上,进一步利用在线预测网站对子痫前期患者血清差异表达miR-23b-5p的靶基因进行预测,并对预测的靶基因进行生物信息学分析,对重点靶基因进行文献调研,为后续对miR-23b-5p靶基因的验证及子痫前期病因学的研究提供理论基础及思路。

1 资料与方法

1.1 数据筛选及靶基因的预测分析

GEO(Gene Expression Omnibus)数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)是一个存储各种高通量实验数据的公共存储库。从中选择子痫前期胎盘脐血差异表达的芯片数据集GSE119799。……

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