桑品种桂桑优12的转录组生物信息学分析*

张朝华 王 霞

(广西壮族自治区蚕业技术推广站，南宁 530007)

桑树(MorusL.)作为养蚕业的饲料树种具有重要的经济价值，近10多年桑树的生态价值、药食用价值、畜禽用饲料价值等被逐渐发掘利用[1]，因而桑树已受到农林业、畜牧业及医疗保健行业的关注。然而，目前桑树的基础研究还相对滞后，例如桑树对不良环境的适应能力、桑树含有的许多活性物质及药用功效等，虽然都有一定的试验证据支持，但还不能从分子水平解析其产生、形成机制。利用基因组、转录组及蛋白质组学等组学技术探讨植物的生理活动规律及生物代谢的机制[2]，成为当下的研究热点。自2013年西南大学何宁佳的研究团队完成了川桑(Morusnotabilis)的基因组测序工作[3]之后，桑树功能基因组的研究也取得了重要进展[4-6]。转录组学是由Velculescu等[7]在1997年提出，了解转录组对于分析基因表达和鉴定未知基因，揭示细胞与组织的分子成分以及理解生长发育和抗性形成等是必不可少的，目前转录组学已应用于多种植物的研究[8-10]。我们拟对桑树品种桂桑优12的根部总RNA进行转录组测序，利用生物信息学软件对测序数据进行拼接组装分析，对unigene进行功能分类注释等，希望能够为桑树重要性状基因的发掘及功能分析，为桑树遗传图谱构建以及分子育种积累一定的基础数据。

1 材料与方法

1.1 桑树材料

桂桑优12为广西蚕业技术推广站育成的桑树品种，以该品种的3年生植株根部材料供试。

1.2 总RNA提取及检测

按照天根植物总RNA提取试剂盒DP432的说明书操作提取桑树根尖总RNA，经1%琼脂糖凝胶电泳检测RNA提取质量。……