南海海绵Pseudoceratina sp.化学成分的细胞毒协同增效作用及靶点预测

2021-10-26 08:23:58竺婷婷袁慧慧胡瑾怡蓝闽波
华东理工大学学报(自然科学版) 2021年5期

竺婷婷, 袁慧慧, 胡瑾怡, 蓝闽波

(华东理工大学化学与分子工程学院,上海市功能性材料化学重点实验室,上海 200237)

海绵占海洋生物物种的6.7%,其结构独特、活性优异的次级代谢产物[1]是海洋药物先导物的重要来源之一。海绵Pseudoceratinasp.属于Verongida 目Aplysinellidae Bergquist 科[2],广泛地分布在澳大利亚大堡礁[3]和南澳海域[4]、加勒比海[5]、瓦努阿图海[6]、日本冲绳岛[7]及中国南海海域[8-9]。该属海绵的化学成分以溴代衍生物为代表,显示出多种生物活性,如杀疟原虫活性、广谱的抗菌性、抗肿瘤活性,以及作为小分子抑制剂治疗癌症、纤维化和其他疾病等。

本文目的是以肿瘤细胞毒活性为导向,在我国南海海绵Pseudoceratinasp.中分离和筛选出具有高活性的化学成分。在天然产物的药用活性物质发现过程中,除了基础的细胞试验外,当得到某个结构明确的化合物,可通过综合评估化合物和靶标结构的相关性、活性基团的类型等因素,对靶标进行排序,通过靶标已知的效用筛选与化合物活性作用相关的靶标,分析和预测可能的靶标,最后进行验证,从而大大提高活性物质的筛选效率。文献[10]在利用软件SHAFTS[11]在计算化合物3D 分子相似性的基础上设计开发了Chemmapper Server,在ChEMBL、Drug-Bank、BingDB、PDB、KEGG等数据库中寻找与目标化合物3D 构型相似的小分子的靶标来预测目标化合物的靶标,并根据随机游走算法对目标化合物与靶标结合度进行排序,通过该算法不仅成功地开发了老药新用,而且筛选出了新型冠状病毒的抗病毒药物用于临床治疗[12]。

本文……

登录APP查看全文