石硕,王晨,林海帆
①上海科技大学 免疫化学研究所,上海 201210;②耶鲁大学医学院 干细胞中心和细胞生物学系,纽黑文,康涅狄格州 06510,美国
PIWI蛋白是PAZ/PIWI结构域蛋白质家族(PPD家族)的两个亚家族之一,常与另一亚家族(Argonaute亚家族)统称为Argonaute(Ago)蛋白。所有PPD家族蛋白都高度保守,它们包含一个相对可变的N端结构域、位于中部的PAZ与MID结构域及位于C端的PIWI结构域。PAZ与MID结构域一起结合一个小RNA[1-2](图1a和1b)[3],而C端的PIWI结构域类似于RNase H,有一些PPD蛋白的PIWI结构域可以切割目标RNA[4-6]。Ago亚家族蛋白在大多数细胞中广泛存在,它们结合microRNAs (miRNAs)和小干扰RNA(siRNA)。这两种RNA都是以依赖Dicer的方式由双链RNA前体加工而成的长度为20~22个核苷酸的成熟小RNA[7]。相比之下,PIWI亚家族蛋白主要在生殖系中表达,尽管在大多数节肢动物中,PIWI蛋白也在体细胞系中表达[8-10]。PIWI蛋白结合一类特定的小RNA——piRNA(PIWI-interacting RNA),这类小RNA的长度一般在24~32个核苷酸,也主要在生殖系中表达[11-14]。
在大多数生物体中,piRNA是由长单链前体以非依赖Dicer方式加工而成的(图1c),但线虫除外。在线虫中,piRNA (21 U-RNA)是由短单链前体(约26个核苷酸长度的加帽的转录本)以非依赖Dicer的方式加工而成的[15-16](图1d)[3]。长单链前体RNA是由基因组上称为piRNA簇的位点区域转录并通过乒乓循环路径加工而来的。乒乓循环路径可通过不断促进前体产生,从而以转录后调控的方式扩增有重叠互补的piRNA。前体RNA通过与其结合的PIWI蛋白交替作用从而加速前体的生产[4,11-14,17](图1c)[3]。当PIWI蛋白在起始piRNA的引导下切割互补的靶标转录本,生成具有单磷酸化5'末端的前前体piRNA(prepre-piRNA)时,这一乒乓循环路径就开始了。……