基于测序基因分型技术的3种石斛兰遗传关系分析

王趁芳，黄守程，周玉丽，王晓鹏，刘爱荣，侯北伟，叶梅荣*

（1.安徽科技学院，安徽凤阳233100；2.南京野生植物综合利用研究所，江苏南京211100）

测序基因分型技术（Genotyping by sequencing，GBS）是基于二代测序技术的简化基因组测序，可以检测大量单核苷酸（Single nucleotide polymor⁃phisms，SNP）变异位点，并且成本低［1］。SNP为第三代分子标记、具有密度高、分布范围广、遗传稳定、分型简单、可自动化等优点［2］，SNP多态性是指由于单个核苷酸变异所引起的基因组上DNA序列的多态性［3］。目前GBS-SNP标记已广泛用于动植物群体的进化、育种、亲缘关系、遗传结构、物种鉴定等研究［4］。如周萍萍等［5］利用该标记研究栽培六倍体燕麦（Avena sativaL.）的起源；Talaveraet al.［6］应用该标记研究牛油果（Persea americanaMill.）的遗传多样性和群体结构。

霍山石斛（Dendrobium huoshanenseC.Z.Tang and S.J.Cheng）、铁皮石斛（Dendrobium officinaleKimura et Migo）和 细 茎 石 斛（Dendrobium monili⁃forme（L.）Sw.）均为兰科（Orchidaceae）石斛属（Den⁃drobiumSw.）多年生附生草本植物，是我国传统名贵的药用植物［7］。霍山石斛俗称米斛、霍石斛等，仅分布在我国大别山区，如湖北英山、河南南召、安徽霍山等地区［7］；而铁皮石斛和细茎石斛分布范围广泛，从我国云南最南部的热带到北部的河南省均有分布［8-9］。霍山石斛的茎杆加工成的枫斗被称为“金霍斗”，为“枫斗之王”；而铁皮石斛和细茎石斛的茎杆被加工成著名的中药“铁皮枫斗”和“铜皮枫斗”［10-11］。中国约有40多种石斛作为传统的中药药材，具有重要的药用和保健功能，据《神农本草经》记载“石斛，一名林兰。味甘，平，无毒。主伤中，除痹，下气，补五藏虚劳赢瘦，强阴。久服厚肠胃，轻身延年”［12］。现代药理研究表明，石斛具有养胃润肺、清音明目、增强免疫力、抗氧化、抗肿瘤、降血糖、防衰老和延年益寿等功效［13］。……