自然衰老C57BL/6J雄性小鼠肝脏的定量与乙酰化修饰蛋白质组学特征

柳江枫，杨晔宏，武 乐，杨俊涛

1中国医学科学院 北京协和医学院 基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室，北京 100005

2南开大学统计与数据科学学院，天津 300071

衰老是存在于大多数生物体的复杂生物学过程，伴随时间依赖性的功能衰退[1]。衰老和衰老相关疾病已为个体和社会带来日益增长的负担[2]。因衰老的进展机制复杂，至今尚不明确，所以一直缺少能够有效延缓衰老的方案。生物组学技术在系统性研究复杂生物学过程中具备优势，并已应用于衰老研究领域[3]。既往研究表明，衰老过程伴随基因组不稳定、表观遗传改变、蛋白质稳态丢失和代谢紊乱[1，4]。作为人和小鼠最大的代谢器官，肝脏在衰老过程中整体变化的研究资料尚不全面。衰老肝脏的生理学变化不明显[5- 6]，但分子层面已发生特征性改变。既往与肝脏衰老相关的整体性组学研究大多涉及转录组学[7- 8]、DNA甲基化特征[9- 10]、单细胞测序[11]等领域，而蛋白质组学研究资料较少。本研究采用串联质谱标签(tandem mass tag，TMT)标记定量和液相色谱串联质谱联用技术，联合比较了年轻与年老小鼠肝脏的蛋白质组学与乙酰化修饰蛋白质组学特征，以期为继续深入开展衰老研究提供有效数据集。

材料和方法

实验动物及分组野生型雄性C57BL/6J小鼠24只，购自北京维通利华实验动物技术有限公司，其中，2月龄小鼠14只(年轻组)，18月龄小鼠10只(年老组)。本研究经中国医学科学院基础医学研究所实验动物使用管理与伦理委员会批准，动物实验伦理审查编号ACUC-A02- 2013- 001。……