基于DCE-MRI影像组学非负矩阵分解的乳腺癌病理信息缺失填充研究

2021-11-12 02:02:30付振宇厉力华
中国生物医学工程学报 2021年4期
关键词:乳腺癌特征信息

付振宇 范 明 厉力华

(杭州电子科技大学生物医学工程与仪器研究所,杭州 310018)

引言

乳腺癌是最常见的女性癌症[1]。2019年国家癌症中心发布的中国癌症报告显示,在过去10余年中,乳腺癌患者的生存率呈上升趋势,但由于临床早期就诊率低和晚期病例临床诊疗不规范等原因,我国乳腺癌的5年生存率仍与美国等发达国家存在差距[2]。在乳腺癌诊疗中,对乳腺癌临床病理信息进行准确判断,可为乳腺癌的精准治疗提供有效参考。乳腺癌病理报告是诊断和治疗的主要依据,常见的病理信息包含乳腺癌组织学分级、Ki-67表达和分子分型等,其中乳腺癌分子分型对于选择合适的个性化治疗方法有很大帮助,有助于乳腺癌的精准诊疗。

在乳腺癌的实际诊疗过程中,可能存在病理信息不全或者病理报告缺失的问题,这对乳腺癌的精准诊疗造成困扰。肿瘤基因表达数据具有维数高、样本量少、冗余信息大且容易出现数据缺失的情况[3-4],目前针对缺失数据的填补方法包括:一是列表式删除法,即将存在缺失数据的行简单地从矩阵中删除,以得到一个完整的数据集;二是利用特定值来填补;三是利用统计学方法进行填补估计,如行均值、K近邻法、贝叶斯主成分分析法[5]、支持向量回归[6]等。这些缺失数据填补方法进展较快,但也存在一定问题:列表式删除法直接删除了许多有效信息;特定值填充法或行均值法没有考虑数据本身属性之间的关系;其他的填补方法也仅关注基因数据本身,没有考虑使用其他辅助信息来提升填补精度。……

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