二代测序检测在无反应性肺炎诊治中的临床应用

林 海，袁小亮

（赣南医学院第一附属医院呼吸与危重症医学科/国家老年医学临床研究中心赣南分中心，江西 赣州 341000）

社区获得性肺炎（Community acquired pneumonia，CAP）是一种常见的感染性疾病，部分CAP经初始抗感染治疗无明显改善甚至恶化，即无反应性肺炎（Nonreactive pneumonia，NP），其病死率为普通CAP的3～5倍，总病死率可高达49.00%［1］，因此引起感染的病原体的鉴定和特征分析对于准确治疗和加速康复极为重要［2］。多数患者住院前已使用过抗生素抗感染治疗，以致传统检测方法费时且阳性检出率低［3］。此外，基于培养的技术，核酸扩增试验和免疫学分析只针对目前已知的一小部分病原体，且敏感性欠佳，因此通常容易出现假阴性结果，可能导致滥用或过度使用抗生素［4］。

随着分子生物学的发展，基于全基因组的新一代微生物测序（Next-generation sequencing，NGS）的价值逐渐被人们所认识，特别是用于检测罕见、非典型或生长缓慢的微生物［5］。NGS主要用于临床评估无菌体液，包括脑脊液、血液和关节积液［6］。对于非无菌体液，如痰和支气管肺泡灌洗液（BALF），NGS的应用相当有限。除了人类基因组干扰和其他常见问题之外，对NGS结果的解释（区分定植和感染）也是一个主要问题。近年来，mNGS在呼吸道感染病原学检测和鉴定中的可行性已被证实［7］。本研究总结了30例无反应性肺炎患者BALF的mNGS结果，并试图通过对测序结果的解读，验证mNGS在无反应性肺炎诊断中的价值。

1 资料与方法

1.1 一般资料与标本收集 回顾性分析2019年1—12月我院呼吸与危重症医学科收治的30例无反应性肺炎患者的临床资料（参照《中国成人社区获得性肺炎诊断和治疗指南2016版》标准）［8］。……