COL3A1在头颈鳞癌中的表达研究①

何 超，张 雪， 刘 爽

(佳木斯大学基础医学院，黑龙江 佳木斯 154007)

头颈鳞癌包括颈部肿瘤、耳鼻喉科肿瘤以及口腔颌面部肿瘤三大部分，发病率较高的为口腔鳞癌、鼻咽癌、喉癌。超过90%的头颈部肿瘤为鳞状细胞癌。最近10年全球头颈部鳞状细胞癌的发病率明显上升，全球每年约有645，000例新发生的头颈部癌病例[1，2]。在大多数国家，头颈部肿瘤男性多于女性，且年龄≥50岁者多见。头颈鳞癌发病隐匿，且容易发生淋巴结转移，手术后复发风险高，5年生存率不足50%[3]。TCGA数据库是由美国国家癌症研究所与美国国家人类基因组研究所合作建立的癌症研究项目，汇总了癌症相关的各种组学数据，是目前世界最大的癌症研究参考数据库。TCGA数据库免费提供33种癌症的DNA、RNA、miRNA测序结果以及SNP、甲基化测序等多维度数据，通过这些信息帮助各国研究者分析癌症特异性表达的基因[4]。我们课题组使用GEPIA在线软件对TCGA数据库分析头颈鳞癌特异性基因，并在细胞水平进行验证，为头颈鳞癌特异性生物标志物的寻找提供实验基础。

1 资料与方法

1.1 数据获取及差异分析

通过GEPIA在线软件进行泛癌分析COL3A1在31种癌症中表达差异，进而分析COL3A1在头颈鳞癌人群与正常人群中表达水平，以及在头颈鳞癌不同阶段表达情况。

1.2 实验材料

正常口腔成纤维细胞株hMOF,口腔鳞状细胞癌细胞株KB与CAL-27,由口腔医院关键教授惠赠。DMEM培养基，胎牛血清，TRIZOL试剂(购自碧云天生物公司)，反转录试剂MightyScript 第一链 cDNA 合成Master Mix，荧光定量SYBR-qPCR Kit扩增试剂盒(购自上海生工生物公司)。……