基于数据挖掘分析RASAL2在胃癌中的表达及其临床意义

2021-11-22 09:25:38范文洁陈象逊周梦熙罗薇薇
安徽医学 2021年10期
关键词:胃癌数据库血清

范文洁 陈象逊 周梦熙 罗薇薇 杨 林

胃癌是全球第5位常见肿瘤,也是造成癌症死亡的第2位病因。在我国,胃癌的发病率和死亡率均居第2位,每年新增病例多达40万,已经成为威胁民众健康的重大疾病之一。由于起病隐匿,多数患者在确诊时已处于疾病晚期,治疗效果多不理想。研究表明晚期或转移性胃癌患者的中位生存期不足1年。由此可见,深入研究胃癌发生发展机制以及寻找潜在的防治靶标具有重要的理论与实际意义。类RAS激活物2(RAS protein activator like 2,RASAL2)是一种Ras-GTP酶活化蛋白(RasGTPase-activating protein,RasGAP),隶属于SynGAP家族,于1998年首次在前列腺癌中发现,基因定位于人类1号染色体长臂1q24-25。RASAL2参与了胰腺癌、结直肠癌、乳腺癌等多种肿瘤的发生发展过程。然而,RASAL2是否参与胃癌发病以及影响胃癌患者预后尚无报道。因此,本研究基于生物信息学,利用Oncomine、GEPIA、cBioPortal等肿瘤数据库综合分析RASAL2基因在胃癌中的表达、变异及其与预后的关系,并通过体外实验验证RASAL2在胃癌细胞增殖、迁移和侵袭中的作用,以期为后续研究提供线索,也为胃癌的防治提供潜在分子靶标。

1 材料与方法

1.1 材料 人胃癌细胞株MGC-803购自中国科学院上海细胞生物学研究所。RPMI 1640培养基、0.25%胰酶、胎牛血清均购自Gibco公司。CCK-8试剂盒购自APExBIO公司。LipofectamineRNAiMAX购自Thermo Fisher Scientific公司。RASAL2-siRNA购自上海拓然生物科技有限公司,序列为:正义链5’-GCAAGAUCAUCAACUCUUAdTdT-3’,反义链5’-UAAGAGUUGAUGAUCUUGCdTdT-3’,按说明书以50 μL RNAase-free HO/nmolsiRNA溶解为20 μM储存液,置于-20 ℃冻存待用。RASAL2抗体购自Santa Cruz公司,GAPDH抗体购自Servicebio公司。Transwell小室(24孔)、Matrigel基质胶购自SIGMA公司。

1.2 生物信息学分析 使用Oncomine数据库检索RASAL2在不同组织肿瘤中的基因表达情况。……

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