王灿铭,张慧萍,黄旻然,吴映雪,泮晓丹,胡锦林,应莉莎,苏丹
在精准医学时代,随着转化医学研究的快速发展,组织样本的需求日益增长。虽然甲醛固定的石蜡包埋组织能解决部分研究的需求,但在大多数情况下,冷冻组织更受研究者的青睐,尤其是保存完好及高质量的样本,可确保下游实验的顺利进行和结果的准确性。通常,研究者对冰冻样本的核酸质量和浓度比较关注,是下游分子生物实验前的常规检测[1],但冰冻样本病理质控常被忽略,如病理诊断的再复核及肿瘤细胞含量等。有研究表明,10%的冷冻组织样本不适合下游分子检测,主要原因包括取材或诊断的不准确可导致研究结果偏倚[2]。冰冻组织样本病理质控在转化研究中扮演着至关重要的作用。本研究对93 例非小细胞肺癌共848 份组织样本进行冰冻染色、病理诊断复核和肿瘤细胞含量评估。此外,对部分组织DNA 及RNA浓度与质量进行分析,为下游RNA测序和基因组测序的顺利进行和结果分析及解读奠定基础。现报道如下。
1.1 组织样本 选取中国科学院大学附属肿瘤医院生物样本库2008 年4 月至2015 年7 月在-80 ℃低温冰箱保存的非小细胞肺癌样本93 例,其中鳞癌65例,腺癌28 例;手术时年龄44 ~77 岁,平均(63.4±7.3)岁;均为男性。根据生物样本库的样本库存情况,每个病例取肿瘤组织、癌旁组织(离肿瘤组织1 ~1.5 cm处)和远离肿瘤的正常组织(离肿瘤组织5 cm以外或更远处)各1 ~4 份,共计组织样本848 份。其中肿瘤组织315 份,癌旁组织204 份,正常组织329 份。……