玉米S1Fa-like 转录因子基因家族的鉴定与表达分析

2022-09-03 11:36:04赵东波高建胜郭建军李拥军郭良海
天津农业科学 2022年8期
关键词:植物分析

赵东波,高建胜,郭建军,李拥军,薛 鑫,郭良海

(1.德州市农业科学研究院,山东 德州 253015;2.德州学院,山东 德州 253023)

转录因子通过激活或者抑制相关基因的表达,提高植物的非生物胁迫耐受性。转录因子S1Fa 最早从菠菜中发现,是含有70 个氨基酸的小肽,负调控rps1 表达,其保守结构域包含核定位信号和特定的DNA 结合位点,在双子叶植物和单子叶植物之间高度保守,主要在根和黄化幼苗等组织中表达。S1Fa-like TFs(transcription factors)的数量在不同的植物种类中差异很大。大多数植物不超过5 个S1Fa-like 家族成员;然而花生基因组中含有126 个S1Fa-like 转录因子,且被鉴定为膜结合型转录因子。越来越多的研究发现,S1Fa-lik TFs 响应植物的非生物胁迫,如甘蓝型油菜(Brassica napus)中S1Fa-like响应盐胁迫刺激;棉花(Gossypium hirsutum)中S1FalikeTFs 大多数成员受非生物胁迫刺激表达量下调;杨树(Populus trichocarpa)中PtS1Fa1 和PtS1Fa2 的表达受到干旱和盐胁迫的抑制,且响应ABA、MeJA、SA等激素刺激,其中PtS1Fa2 通过增加抗氧化剂活性,减少活性氧(ROS)积累,进而增强杨树的耐旱性。

植物在生长发育过程中必须应对非生物胁迫,如土壤盐度、干旱和极端温度。然而,关于玉米S1Fa-like TFs 生物信息学、组织表达及胁迫调控表达模式的研究未见报道。本研究采用生物信息学方法,分析玉米S1Fa-like TFs 基因结构、染色体定位、蛋白理化性质、进化关系及组织表达和胁迫表达模式,通过qRT-PCR 技术检测玉米S1Fa-like TFs 受热胁迫时的表达量,为深入解析玉米S1Fa-like TFs在响应非生物胁迫应答中的生物学功能奠定基础。

1 材料和方法

1.1 基因家族的鉴定、蛋白质理化性质及亚细胞定位分析

从……

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