基于网络药理学探讨水红花子抗肝硬化机制

2022-09-13 09:17:46杨涵崔银峰范忠义朴燕张昌浩金莉莉
延边大学学报(自然科学版) 2022年2期
关键词:数据库

杨涵, 崔银峰, 范忠义, 朴燕, 张昌浩, 金莉莉

( 延边大学 药学院, 吉林 延吉 133002 )

0 引言

肝硬化(liver cirrhosis, LC)是坏死肝脏纤维组织弥漫性增生而导致肝脏的正常结构遭到破坏的一种疾病[1].目前,肝硬化的发病机制尚不明确,西医对其治疗仍不理想.近年来一些学者采用传统中医治疗肝硬化取得了一定疗效[2-4].临床研究[5-6]显示,水红花子(Fructuspolygoniorientalis)可用于治疗胃脘胀痛、散血消淤、消积止痛等,且对慢性肝炎、肝硬化以及肝纤维化等也有一定的治疗效果.基于此,本文基于系统生物学理论,利用网络药理学和分子对接方法探讨水红花子治疗肝硬化的作用机制,并通过构建药物 - 靶点- 疾病网络对其进行系统的网络分析,进而对药物作用的机制进行预测,以期为水红花子治疗肝硬化提供理论依据和临床参考.

1 实验方法

1.1 水红花子治疗肝硬化的网络药理学研究的基本思路

水红花子治疗肝硬化的网络药理学研究的基本思路见图1,具体为:①利用TCMSP数据库对水红花子的活性成分进行筛选;②利用Uniprot数据库对水红花子活性成分的基因进行注释,以此获得水红花子活性成分的靶点基因名;③利用GeneCards数据库筛选出肝硬化的靶点基因;④在获得水红花子与肝硬化交集基因的基础上,利用Cytoscape 3.8.0软件和String数据库构建水红花子有效成分 - 肝硬化的靶点基因网络、蛋白质相互作用网络;⑤利用DAVID数据库对水红花子与肝硬化的交集基因进行GO与KEGG富集分析;⑥利用AutoDock Vina 1.1.2软件对水红花子有效成分的配体小分子……

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