普通烟草Dof转录因子家族的全基因组鉴定及分析

2022-09-21 01:37:26赵振祥崔露莹周东波赵泽玉张银霞盖梦琦解敏敏蒲文宣李志远
中国烟草科学 2022年4期
关键词:烟草分析

赵振祥,崔露莹,周东波,赵泽玉,张银霞,盖梦琦,解敏敏,蒲文宣,彭 宇,李志远*

普通烟草Dof转录因子家族的全基因组鉴定及分析

赵振祥1,崔露莹2,周东波1,赵泽玉3,张银霞1,盖梦琦2,解敏敏2,蒲文宣1,彭 宇1,李志远2*

(1.湖南中烟工业有限责任公司技术中心,长沙 410007;2.中国农业科学院烟草研究所,烟草行业基因资源利用重点实验室,青岛 266101;3.湖北中烟工业有限责任公司三峡卷烟厂,湖北 宜昌 443100)

Dof(DNA binding with one finger)蛋白是植物特有的一类转录因子,在植物的多种生命进程中发挥着重要作用。为解析烟草中Dof家族成员在生长发育过程中的潜在作用,本研究利用比较基因组学、进化分析、共线性分析等方法解析烟草中的Dof家族成员的潜在生物学功能。结果表明,在烟草基因组中共鉴定到69个Dof转录因子,其Dof功能域在进化上十分保守,根据系统进化分析结果将其划分为9个亚家族。共线性分析表明,烟草中的16个基因与拟南芥17个基因有27个共线性基因对,同时,25个基因被检测到存在17个全基因组复制对,表明复制事件在烟草基因家族的扩张中起关键作用。此外,表达模式分析表明基因的表达存在明显的组织特异性,其中和基因可能与根系生长发育有关。本研究对烟草基因组中的Dof转录因子进行了系统的鉴定和分析,为烟草Dof转录因子家族成员的功能研究奠定了基础。

普通烟草;Dof转录因子;鉴定;比较基因组学;表达模式

转录因子(Transcription factors, TFs)可以识别并结合下游靶基因启动子上的顺式作用元件,进而调控下游基因的表达[1]。……

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