糖尿病肾病患者血浆细胞游离DNA中羟甲基化修饰lncRNA的筛选及其ceRNA调控网络构建

储金林，马睿瑶，铁璐，李琳琳

1新疆医科大学药学院，乌鲁木齐 830011；2北京大学基础医学院药理学系

糖尿病肾病（DKD）是终末期肾病的常见原因，是糖尿病的主要并发症之一，严重影响糖尿病患者的整体生活质量。细胞游离DNA（cfDNA）是由于不同组织细胞死亡而降解的DNA片段释放到血浆中，携带了起源细胞的遗传和表观遗传信息，检测血浆cfDNA可视为一种“液体活检”，有利于开展各种相关诊断，避免有创的组织活检［1］。5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）主要是5-甲基胞嘧啶通过TET酶氧化形成，是活性DNA去甲基化相对稳定的中间体，被认为是重要的表观遗传特征［2］。研究表明，血浆cfDNA的5hmC谱是癌症及糖尿病等相关疾病早期检测和进展监测的有力工具［3-5］。长链非编码RNA（lncRNA）是在转录和转录后水平上通过调控各种机制，从而影响基因表达的重要因子［6-7］。有研究表明，lncRNA基因表达也可能受到表观DNA修饰的调控，如DNA甲基化和组蛋白修饰［8-9］，而对编码lncRNA的基因组区域中潜在5hmC变化的研究较少。2021年2月—2022年2月，我们采用5hmC-Seal测序方法探讨DKD患者血浆cfDNA中编码lncRNA的基因组区域的关键5hmC改变，再进行lncRNA、miRNA和mRNA的调控网络分析，筛选可能的作用分子，为DKD的后续机制研究及诊疗策略奠定基础。

1 材料与方法

1.1 标本来源 收集北京大学第三医院收治的2型糖尿病（DM）患者14例，其中男9例、女5例，年龄31～62（47.9±6.9）岁；DKD患者17例，男9例、女8例，年龄32～77（51.1±16.7）岁。DM的诊断依据美国糖尿病协会（ADA）2020年发布的标准［10］，DKD的诊断依据KDIGO 2020临床实践指南和2014年中国糖尿病学会糖尿病肾病防治共识［11］。本研究通过北京大学第三医院伦理委员会审批，受试者均知情同意。……