基于生物信息学分析miR-629-3p在头颈部肿瘤发生中的作用

杨 军 隋承光 李 妍 孟凡东

【提 要】 目的 探讨微小RNA(miRNA-629-3p)在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其相关临床意义。方法 通过TCGA数据库数据进行生物信息学方法分析,获得在头颈部肿瘤中表达的微小RNA,选取高表达的miR-629-3p;K-M plot观察miR-629-3p对患者生存的影响;TIMER2.0分析与免疫浸润的相关性;Western blot法检测相关蛋白的表达采用水平。结果 miRNA-629-3p在头颈部肿瘤患者中高表达; miR-629-3p作为预测生存预后的一个指标具有较高的敏感度和特异度;免疫浸润分析得出,T、B及NK细胞参与了头颈部肿瘤的浸润,且与miR-629-3p的表达具有明显的相关性;沉默miRNA-629-3p后,Wnt、β-catenin和Survivin的表达水平明显降低,而E-cadherin的表达水平明显升高。结论 头颈部肿瘤患者的miRNA-629-3p表达水平上调,可能在恶性转化过程中起到重要作用,有望成为评估头颈部肿瘤患者病情的有效指标。

头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous-cell carcinoma,HNSC)是目前最常见的恶性肿瘤之一,严重威胁人类的健康,主要累及头颈部不同的组织和器官[1]。HNSC的临床治疗方案主要根据肿瘤的TNM分期制定。综合治疗以手术、放疗、化疗[2]及免疫治疗为主[3]。HNSC的治疗虽然取得了一定进展,但5年生存率并没有显著提高[4]。因此,早期诊断、准确的预后评估和进一步的有效治疗是非常必要的。为改善疾病预后,全面了解肿瘤的发病机制,及时寻找可靠的肿瘤标志物提高HNSC患者的治疗效果,制定有效的治疗方案具有重要的临床意义。

微小RNA(microRNA,miR)是一类由内源基因编码的非编码单链RNA,其数量仅占整个基因组的l%,主要在转录后水平调控基因的表达。miR-629-3p是一种促癌因子,已经被报道参与乳腺癌、肺腺癌和喉癌等恶性发展过程[5-6]。……