副流感病毒5型的分子生物学研究进展

2016-12-01 09:17高菽蔓靳红亮扈荣良
中国动物传染病学报 2016年2期
关键词:衣壳流感病毒结构域

高菽蔓,靳红亮,2,马 嫄,3,扈荣良

(1.军事医学科学院军事兽医研究所,长春130122;2.吉林农业大学动物科学技术学院,长春130118;3.吉林大学公共卫生学院,长春130021)

·综述·

副流感病毒5型的分子生物学研究进展

高菽蔓1,靳红亮1,2,马 嫄1,3,扈荣良1

(1.军事医学科学院军事兽医研究所,长春130122;2.吉林农业大学动物科学技术学院,长春130118;3.吉林大学公共卫生学院,长春130021)

副流感病毒5型(Parainfl uenza virus 5,PIV5)为一类不分节段单股负链RNA病毒,可引起多种动物呼吸道感染,尤其可致犬病发“犬窝咳”。本文围绕PIV5病毒特征、基因组特征、编码蛋白、病毒的转录与复制以及PIV5相关疫苗的研究做一综述,旨在为PIV5疾病监测和PIV5相关疫苗研究提供科学依据。

副流感病毒5型(PIV5);RNA病毒;分子生物学特征

副流感病毒5型(Parainfluenza virus 5,PIV5)为单股负链不分节段RNA病毒,属于副黏病毒科(Paramyxoviridae),最初因猴病毒5型(Simian virus 5,SV5)而著称[1]。PIV5与SV5、同属的猴病毒41(Simian virus 41,SV41)和人副流感病毒II型(human paramyxovirus type 2,hPIV2)等同源性较高[2]。PIV5是犬病原体之一,通过呼吸道途径可引起急性自我限制性支气管炎,甚至继发肺炎和机会菌等感染,引发“犬窝咳”[3],故兽医领域通常称其为犬副流感病毒(Canine parainfluenza virus,CPIV)[4]。幼犬最易感该病毒,发病急,传播快,病毒呈世界性分布。此外,猫、仓鼠、豚鼠、猪、人等均有感染报道,但多不发病,呈隐性感染[5]。

1 病毒特性

PIV5属于副黏病毒科(Paramyxoviridae),副黏病毒亚科(Paramyxovirinae),腮腺炎病毒属(Rubulavirus),病毒粒子直径为150~200 nm,通常呈圆形[6]。PIV5可以感染包括人类细胞在内的多种细胞,且在大多数细胞中均可获得高滴度的病毒,其中在非洲绿猴肾细胞(Vero细胞)培养滴度高于1010PFU / mL[7],为该病毒的疫苗生产创造了有利条件[8]。PIV5生命周期中不存在DNA阶段,只在感染细胞的胞浆中增殖,且该种病毒几乎不产生细胞病变[8],可通过基因表达引起广泛的非炎性、非致病性的免疫反应[9,10]。PIV5感染的细胞在4℃具有红细胞吸附作用,常用的红细胞如豚鼠的红细胞;该病毒可以凝集豚鼠、鸡、猴等的红细胞,在4℃下对鸡红细胞的血凝效价最高[6]。

2 PIV5的基因组特征

PIV5基因组为单股负链不分节段的RNA,长15 246 bp,在副黏病毒科病毒中最小,遵循“六碱基原则”,其结构式为3'-NP-V/P-M-F-(SH)-HN-L-5',其中两侧为3'端非编码区(即前导序列,leader sequence)和5'端非编码区(即尾随序列,trailer sequence),病毒每个基因都具有转录起始信号(gene start,GS)和转录终止信号(gene end,GE)序列,各基因之间均含有一段长短不一的短间隔区(intergenic region,IGR),但不构成mRNA成分,使各基因互不重叠,分别以单独的mRNA进行表达[11],这些保守序列参与mRNA的起始和终止,是重要的转录调控信号[12]。各基因编码产生蛋白分别为核衣壳蛋白(neucleocapsid protein,NP)、磷酸化蛋白(phosphoprotein,P)、V蛋白(V protein,V)、膜基质蛋白(matrix protein,M)、小疏水性蛋白(small hydrophobic protein,SH)、血凝素-神经氨酸酶(hemagglutininneuraminidase,HN)、聚合酶蛋白(large polymerase protein,L)(见图1)。

图1 PIV5的基因组结构[13]Fig.1 Genetic maps of PIV5

3 PIV5基因编码蛋白

3.1 核衣壳相关蛋白 NP、P、L三种蛋白和基因组RNA均为PIV5病毒粒子的重要组成部分,为核衣壳的装配和指导病毒转录复制所必需,相互结合可形成核糖核蛋白体(ribonucleoprotein complex,RNPs)[14]。

3.1.1 NP蛋白 NP蛋白又称N蛋白,含有510个氨基酸,NP蛋白单体在形成核衣壳之前,以可溶性复合物的形式与P相结合。NP蛋白氨基端(N端)占NP蛋白的75%,高度保守,与上述可溶性复合物的形成以及核衣壳的组装均有关;羧基端(C端)占NP蛋白的25%,高度可变,含有大量磷酸化位点,并非为核衣壳的组装必需,但对病毒复制非常重要[15,16]。有报道称,NP蛋白C端可能能够结合P蛋白或P/L蛋白复合物[14]。NP蛋白与基因组和反基因组RNA相互结合包装成高度稳定且具有RNA酶抑制作用的螺旋状核衣壳,即形成NP蛋白-RNA复合物,这不仅能够促使RNA复制过程链的延伸,而且有可能能够避免3'端未发生多聚腺苷酸化、5'端未发生加帽的基因组/反基因组发生降解,或者避免被胞浆RIG-I(helicases retinoic acid-inducible gene 1)和MDA5(melanoma differentiation-associated protein 5)所识别,这两个因子可识别三磷酸化RNA、双链RNA,并且能够激活IRF3和NF-ĸB,进而产生IFN-I和促炎因子[17-19]。

3.1.2 P蛋白 P蛋白并非高度保守。P蛋白包含N端和C端两个功能性模块,一个横跨RNA编辑位点的变异间隔区将二者隔开[16]。有报道称,P蛋白为高度磷酸化蛋白,以同源四聚体形式存在[19]。P蛋白的N端模块可与游离的NP蛋白结合,可使NP蛋白以可溶性单体形式存在,这是RNA复制过程中核衣壳的形成所必需的[20,21]。P蛋白的C端模块含有同寡聚化结构域(homo-oligomerization domain)和聚合酶辅助因子结构域(the polymerase co-factor domain),二者是P蛋白中唯一为转录所必需的区域。另外,P蛋白与核衣壳的结合离不开其C端模块的介导作用,它还可与L蛋白结合,介导L蛋白与核衣壳的结合[22,23]。

3.1.3 L蛋白 L蛋白为多功能大蛋白,含有2256个氨基酸,分子量最大,但在病毒中表达量最低,与核苷酸的聚合作用、mRNA的加帽以及甲基化等均有关[24]。L蛋白的N端约占L蛋白的一半,其氨基酸高度保守,被认为是聚合酶结构域[25,21]。L蛋白可与P蛋白结合形成具有RNA聚合酶作用的复合物[22,23]。

3.2 囊膜蛋白

3.2.1 非糖基化囊膜蛋白-M蛋白 M蛋白为高度保守的非糖基化蛋白,含有378个氨基酸,在病毒蛋白中含量最高,位于病毒囊膜的内表面。在被感染细胞中,M蛋白可与细胞膜内表面接触,在病毒装配、出芽和释放中起关键作用[26,27],在指导病毒成分转运到细胞膜过程中也有一定作用[27,28]。M蛋白与N、HN或F蛋白的共表达对PIV5病毒样粒子的形成和释放有一定作用[29,30]。有研究表明,PIV5的M蛋白含有一个在病毒出芽后期可介导宿主泛素-蛋白酶体通路相互作用的结构域[26]。

3.2.2 囊膜糖蛋白

3.2.2.1 F蛋白 F蛋白含有552个氨基酸,是病毒附着宿主细胞后,病毒核衣壳释放到胞浆前与宿主细胞表面脂蛋白膜融合的主要因子。F蛋白是典型的I型跨膜糖蛋白,N端有游离的疏水信号肽,近C端锚定在膜上。F蛋白先以无活性前体F0的形式存在,在宿主细胞内肽酶的作用下裂解产生两个亚基F1和F2,其中N端20%为F2亚基,其余分子为锚定在膜上的F1亚基,二者以二硫键连接[31,32]。F1亚基氨基酸末端为疏水性结构域,具有嵌入细胞膜的融合作用。F0的裂解是病毒感染的先决条件,与病毒组织嗜性和致病力有关[33,34],其裂解位点含有弗林蛋白酶裂解基序(furin cleavage motif),并且病毒的体外复制不需要额外添加蛋白酶[35]。HN蛋白与F蛋白特异性相互结合是病毒-细胞和细胞-细胞融合的必要条件。研究发现,PIV5的F蛋白上含有一个富含疏水残基的免疫球蛋白样结构域(immunoglobulin-like (Ig-like)domain),该结构域可能能够介导F-HN蛋白相互作用[36]。

3.2.2.2 HN蛋白 HN蛋白含有566个氨基酸,HN蛋白单体通过二硫键聚合而成的同源四聚体具有血凝素(hemagglutinin activity,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase activity,NA)双重生物学活性。其中HA活性的存在使HN蛋白能够与宿主细胞外的神经氨酸酶(又称唾液酸)受体以高亲和力结合,受胞外卤离子浓度和pH的正作用,故PIV5具有凝集红细胞的能力。NA活性的存在使HN蛋白能够催化神经氨酸酶水解,受胞外卤离子浓度和pH的负作用[37]。HN蛋白是II型寡聚跨膜糖蛋白,含有一个短胞内域和一个大胞外域,胞外域含有长螺旋形颈部结构和大球形的头部结构,其中颈部易被胰蛋白酶裂解,头部结构具有HA和NA生物学活性,为主要的抗原位点[38]。研究发现,HN蛋白与神经氨酸酶受体结合会引起HN蛋白构象改变,使空间约束得以释放,从而有助于HN蛋白颈部残基与F蛋白相结合[38]。

3.2.3 SH蛋白 SH蛋白含44个氨基酸,为跨膜蛋白,C端位于膜外侧。并非所有PIV5都有SH蛋白,某些犬源和猪源的PIV5毒株因SH基因发生变异而无法编码SH基因,也就不能产生SH蛋白,因此该蛋白对于病毒感染犬和猪是非必需的,犬和猪有可能不是PIV5的自然宿主[39,40]。有研究表明,SV5(含SH基因)缺失SH基因后的重组病毒(rSV5△SH)复制水平未受影响,但其细胞病变程度有所增加,并且病毒在动物体内的致病力减弱,这与SH蛋白能够抑制TNF-α介导的细胞凋亡有关[9,10]。

3.3 附属蛋白-V蛋白 V蛋白为核衣壳的结构成分之一,含有313个氨基酸,是PIV5 P基因发生RNA编辑导致框移而产生的蛋白,该蛋白并非病毒复制所必需的,故称之为附属蛋白(accessory protein),V蛋白也是PIV5基因组中唯一的附属蛋白。V蛋白的C端含有与P蛋白融合的特异性区域,该区域含有7个高度保守半胱氨酸残基,且每个蛋白分子都与两个锌原子结合。研究表明,V蛋白可能不与RIG-I结合,而是与MDA-5结合,从而抑制干扰素的产生。有研究者对PIV5介导的STAT1的降解进行了研究,发现V蛋白能够与泛素连接酶结合,并劫持该复合物使之靶向于STAT1,从而使之发生泛素化和蛋白酶体依赖的降解[17,41]。另外,V蛋白特异性结构域必须按一定规则排列才能发挥抑制IFN产生及其相关信号通路的功能[42]。在病毒感染期,V蛋白还可延迟细胞凋亡,下调病毒转录和RNA复制水平[43],并延长细胞周期[44]。研究发现,V蛋白抑制RNA复制水平的两个关键结构域分别在N端和C端,且二者影响病毒RNA的机制不同,其中N端结构域的L16、I17残基为关键位点,可促进病毒RNA转录,而C端结构域可抑制病毒RNA转录[43]。

4 PIV5的转录和复制

PIV5首先吸附到细胞相应受体上,在中性pH环境下,通过病毒囊膜和细胞外膜融合实现病毒侵入,将病毒螺旋化的核衣壳释放到胞浆中。病毒转录和复制均在胞浆中进行。病毒各基因都有其独立的转录调控区,即GS-IRG-GE,转录酶在该转录信号的指导下,以基因组(genome)RNA为模板,从基因组3'端到5'端依次进行转录,产生3'端多聚腺苷酸化、5'端加帽且甲基化的不重叠的多个单顺反子mRNA,且转录产物的量从3'端到5'递减。最终核糖体将病毒的各基因的mRNA翻译成病毒蛋白,蛋白翻译后再进一步进行加工和修饰。另外,也产生了3'端无多聚腺苷酸化、5'端不加帽的前导序列和尾随序列mRNA转录本,但不翻译为蛋白[37]。

RNA复制过程为病毒RNA聚合酶作用下,以基因组(genome)RNA(-RNA)为模板,合成不含GS/GE序列的反基因组(antigenome),反基因组(+RNA)作为复制中间体,合成子代病毒的负链基因组RNA。反基因组同基因组一样,均为3'端无多聚腺苷酸化和5'端不加帽。病毒多聚酶(转录酶或复制酶)识别的真正模板是NP蛋白-RNA复合物。基因组复制后,又发生下一轮转录(次级转录)、翻译和复制[6]。

5 PIV5相关疫苗研究

治疗“犬窝咳”的活疫苗如四联苗、五联苗、六联苗等已在市场上得到广泛应用[4]。随着反向遗传学研究的不断深入,PIV5因其感染方式直接、宿主范围广泛等诸多优点而备受关注,先后成为流感病毒、狂犬病病毒、呼吸道合胞病毒等重要病原的重组疫苗载体,具有广泛的应用价值和经济价值[8,45]。PIV5载体疫苗研究中,免疫前PIV5抗体水平是否影响PIV5重组疫苗的免疫效果问题不容忽视。有研究发现,已免疫过PIV5的犬再免疫表达甲型流感病毒H3蛋白的重组PIV5疫苗(rPIV5-H3),rPIV5-H3仍有免疫源性,此外,他们还对人群中PIV5抗体水平进行了监测,其中PIV5中和抗体阳性率为29%,且人的PIV5中和抗体水平低于免疫犬[4]。这项研究说明人体内的PIV5中和抗体不影响重组PIV5疫苗的免疫效果,但我们仍需要更多的研究数据来支撑这一说法。

6 结语

目前,除引发“犬窝咳”外,PIV5是否能引起人和其他动物疾病的问题一直存在争议。2015年Liu 等[45]曾报道,在吉林省白城牛场死于呼吸困难和间质性肺炎的犊牛肺组织中分离到一株与猪源KUN-11和SER株高度同源的PIV5(PIV5-BC14株),由于在健康牛中未检测到PIV5,他们据此推测犊牛的疾病很有可能是由PIV5-BC14株引起的。一直以来,PIV5因其非常容易污染细胞培养基,而导致了关于PIV5的分离和相关疾病的报道屡遭质疑,但这仍是一篇发人深省的报道,虽然尚无PIV5能够引起其他疾病的确切报道,但其对人类和动物是否存在潜在威胁,以及PIV5载体疫苗是否存在潜在的安全隐患,确实有待长期监测。

PIV5载体作为基因工程疫苗研究最具应用前景的载体之一,目前,虽然已有众多学者进行了PIV5载体疫苗的相关研究,但其从试验研究到成熟稳定的临床应用,尚需对PIV5分子生物学、病毒嗜性、受体利用、免疫途径以及安全性评价等诸多方面展开更加深入而广泛的研究。

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ADVANCES IN THE STUDY OF MOLECULAR BIOLOGY OF PARAINFLUENZA VIRUS 5

GAO Shu-man1, JIN Hong-liang1,2, MA Yuan1,3, HU Rong-liang1
(1.Military Veterinary Institute, Academy of Military Medical Sciences, Changchun 130122, China; 2.College of Animal Science and Technology, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China; 3.School of Public Health, Jilin University, Changchun 130021, China)

Parainfluenza virus 5 (PIV5) is nonsegmented negative-strand RNA virus which can infect various mammals including humans, especially causing kennel cough.This paper comprehensively introduces biological characteristics of PIV5 concerning their feature, genomic characteristics, proteins, transcription and replication, and research of vaccines based on PIV5, and aims at providing scientifi c basis about the study on the surveillance of PIV5-related diseases and PIV5 and PIV5-vectored vaccine.

Parainfl uenza virus 5 (PIV5); RNA virus; biological characteristics

S852.659.5

A

1674-6422(2016)02-0080-07

2015-12-08

国家高技术研究发展(863)计划(2011AA10A212)

高菽蔓,女,硕士研究生,预防兽医学专业

扈荣良,E-mail:ronglianghu@hotmail.com

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