RT-PCR技术检测猪瘟病毒应用浅析

2020-12-16 05:48陈隆全
中国畜禽种业 2020年3期
关键词:离心管病猪猪瘟

陈隆全

(重庆市綦江区东溪镇畜牧兽医站 401434)

猪瘟是由猪瘟病毒引发的接触性传染病,病死率高,传染速度快,一旦大范围传播,必然给养殖户造成巨大经济损失,威胁我国养殖行业的发展。由于猪瘟病毒临床表现朝向非典型发展,在临床诊断病猪时受到多种因素感染,很难快速准确地提供诊断结果,延误早期隔离,增加了猪瘟传播的风险。

1 材料和方法

由重庆市动物疫病防控中心提供猪瘟病毒阳性对照材料,将病死猪扁桃体和淋巴结进行取样备用。准备RT-PCR 试剂盒、RNA 试剂盒。

2 设计合成引物

使用RT-PCR 合成特异性引物,设计扩增片段为682bp。

3 制备样品

对病死猪进行剖检,在无菌环境下采集扁桃体和淋巴结,研磨后添加生理盐水进行稀释处理。设定5000r/s 经过5min 离心处理,取上层清液为样品。

4 提取病毒基因组总RNA

按照试剂盒说明,取 100μL 上层清液,添加至 1.5mlEP 管中,加入 SolutionR1 100μL。混合后振荡 30s,放在室温环境中静置 60s。经过处理后,添加 SolutionR2 600μL,经过充分混合颠倒后,在室温环境下静置3~5min。添加上层清液后套离心管,再次进行30s 离心处理。将外套管内部液体倒出,添加Wash Buffer 600μL,经过 30s 离心处理后,将接液管内部液体倒出,要进行两次洗涤处理。将空柱放在10000r/min 离心处理,1min 后转移至新离心管中。在新离心管中转入Spin column,膜中央添加 20~50μL Elution Buffer,在室温环境中静置60s,经过 30s 离心处理后,可以得到 RNA,可以在-70℃下保存或者直接扩增处理。

5 扩增处理

将总 RNA 为模板扩增,取 0.4μL 上下游引物,设定 45℃,经过 30min 反转录后,升高至 94℃进行 5min 预变。在 94℃下经过 30s 变性,设定 52℃进行 45s 退火。在 72℃下进行 45s 的延伸,重复35 个循环。在72℃下进行10min 延伸。

6 荧光定量扩增

以总 RNA 为模板扩增,取 0.4μL 上下游引物,0.4μL 探针 ,0.4μL Passive Reference Dye,1μLRNA 模 板 。并 使 用RNase-free Water,添加至 20μL。设定扩增程序,设定 45℃,经过 25min 反转录后,升高至 95℃进行 2min 预变[1]。在 95℃下经过 10s 变性,设定 55℃进行 30s 退火。在 72℃下进行 30s的延伸,重复 5 个循环。在 95℃下进行 10s 变性,在 55℃下进行30s 退火,经过40 个循环,结束后对荧光进行收集。

7 检测结果

7.1 判定标准

检测Ct 值不超过35,扩增曲线表现出明显指数增长期,可以判断样本为阳性。若Ct 值处于35~40 之间,需要进行重复检验,Ct 值仍然处于这一范围,扩增曲线出现指数增长期,可以判断为阳性,否则样本为阴性。若没有检测到Ct 值,或者样本Ct 值超过了40,可以判断样本为阴性。

7.2 扩增结果

提取样本总RNA 进行RT-PCR 扩增处理,使用1%琼脂糖凝胶对产物电泳,对照阳性片段。在682bp 附近,样品有带则可以确定样本为猪瘟病毒阳性。

7.3 荧光定量扩增结果

应用荧光定量RT-PCR 方法检测猪瘟病毒,检测结果为阳性。和RT-PCR 一致,代表病猪已感染猪瘟病毒。

8 讨论

早期诊断对控制猪瘟的扩散十分关键,需要根据病猪发病情况,及早采取先进技术,诊断猪瘟,才能有效控制猪瘟,避免猪瘟蔓延。PCR 技术得到深入研究,逐渐在动物疫病检测中得到广泛应用,同时可以取代传统血清学和病原分离鉴定方法[2]。检测试验通过借鉴成熟检测技术,在兽医诊断中得到广泛应用,有效减少检测时间,让检测结果特异性和精准性得到显著提高,降低猪瘟给养殖行业造成的经济损失。RT-PCR 技术的应用显著提高了检测效率,规避样本污染及假阳性结果的问题。借助于荧光定量PCT 检测的高特异性和高灵敏性,让猪瘟病原体检测快捷准确。

9 结语

综上所述,使用RT-PCR 检测技术检测猪瘟病毒,可快速灵敏的完成猪瘟检测,指导病猪临床诊断,提高诊断效率。快速获得诊断结果后,能将猪瘟病猪快速隔离,采取科学合理的防治手段,避免猪瘟病毒的传播,减少养殖户经济损失。

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